RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	DIABLO	Q9NR28	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	RLN1	P04808	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	CTSG	P08311	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	FXYD4	P59646	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	DLK1	P80370	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552		Q9H521	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	GPR31	O00270	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	CHEK1	O14757	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	SNAPC5	O75971	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	S100G	P29377	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	MFAP2	P55001	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552		Q56UQ5	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF2	Q99496	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552		I3L2K1	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	KRAS	P01116	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	IFNA4	P05014	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	PTHLH	P12272	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	RPA2	P15927	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	LPAR6	P43657	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	IDNK	Q5T6J7	187 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	RARRES2	Q99969	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	CORT	O00230	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	GNG7	O60262	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	G6PC	P35575	357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	NPBWR1	P48145	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	PAX9	P55771	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	MXD1	Q05195	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	PKD1	P98161	4303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	RYR1	P21817	5038 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ATG12	O94817	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	YIF1A	O95070	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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