RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HAGHQ16775 308 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TEX38Q6PEX7 206 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DOK5Q9P104 306 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM218A2RU14 115 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PSMB11A5LHX3 300 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR2T8A6NH00 312 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CLEC3BP05452 202 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF726P1Q15940 193 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RNF125Q96EQ8 232 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UHRF2Q96PU4 802 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00527Q9UJ94 153 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ITPR3Q14573 2671 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDE6DO43924 150 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR2C1O95371 312 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LY6G6DO95868 133 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGKV1-17P01599 117 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHG4P01861 327 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IL4P05112 153 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CD5P06127 495 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ELANEP08246 267 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GCHFRP30047 84 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPIFP30405 207 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GPR183P32249 361 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FOXE3Q13461 319 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CST9LP1Q5W188 147 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SEC11CQ9BY50 192 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RABAC1Q9UI14 185 aa9.55□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 F6UZH7 168 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TGOLN2O43493 480 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLV1-40P01703 118 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV3-23P01764 117 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SFTA3P0C7M3 94 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARL3P36405 182 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCL20P78556 96 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SVBPQ8N300 66 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PAXXQ9BUH6 204 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR51M1Q9H341 326 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 S4R3C0 116 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDZD2O15018 2839 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CTSGP08311 255 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q8N2B8 174 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR4F5Q8NH21 305 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR4F4Q96R69 305 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 METTL26Q96S19 204 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM231Q9H6L2 316 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF702PQ9H963 129 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ITPR2Q14571 2701 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.52□□□□□ -0.88
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C11orf94C9JXX5 98 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM250H0YL14 139 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PAGE4O60829 102 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SNAPINO95295 136 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 APOC3P02656 99 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BMI1P35226 326 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CEBPGP53567 150 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DEFA5Q01523 94 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ICAM4Q14773 271 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SSX7Q7RTT5 188 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF491Q8N8L2 437 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR4X2Q8NGF9 303 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GPR82Q96P67 336 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RARRES2Q99969 163 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.1 ms