RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490081.5

HDAC1-210, Transcript of histone deacetylase 1, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC1, Length 1,047 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1-210ENST00000490081 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 MGAM2Q2M2H8 2515 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM213A2RRL7 107 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 RNF222A6NCQ9 220 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 C2orf70A6NJV1 201 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 TAAR5O14804 337 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 C1QBP02746 253 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 CSN3P07498 182 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 CBLN1P23435 193 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 CRYBB3P26998 211 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 ATP5SQ99766 215 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 U3KQE9 123 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 ZNF320A2RRD8 509 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 SMCO3A2RU48 225 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 AGPAT2O15120 278 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 CD5P06127 495 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 PRR20EP86478 221 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 PRR20CP86479 221 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 PRR20DP86480 221 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 PRR20BP86481 221 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 PRR20AP86496 221 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 ZNF90Q03938 601 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 BTNL8Q6UX41 500 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 BPIFCQ8NFQ6 507 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 HYLS1Q96M11 299 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 SMPXQ9UHP9 88 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 A0A0D9SG52 128 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 YIF1AO95070 293 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 FOLR2P14207 255 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 NPPCP23582 126 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 S100A7P31151 101 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 BMI1P35226 326 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 CAMLGP49069 296 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 ZNF266Q14584 549 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 TM4SF20Q53R12 229 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 S100A7AQ86SG5 101 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 RNF125Q96EQ8 232 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 MGST2Q99735 147 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 MFFQ9GZY8 342 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 VSIRQ9H7M9 311 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.47□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 A0A1W2PS18 150 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 ARPC5O15511 151 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 IFNA5P01569 189 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 IGLV1-51P01701 117 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 IL4P05112 153 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 LINC00869P0C866 280 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 CLINT1Q14677 625 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 OPCMLQ14982 345 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 METTL26Q96S19 204 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 WFDC1Q9HC57 220 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 FBXL17Q9UF56 701 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 RNF24Q9Y225 148 aa9.46□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 SMLR1H3BR10 107 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 JTBO76095 146 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 IGLL1P15814 213 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM231Q9H6L2 316 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 RABAC1Q9UI14 185 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.45□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.44□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 CHEK1O14757 476 aa9.44□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 BUB3O43684 328 aa9.44□□□□□ -0.9
HDAC1-210ENST00000490081 SAP30O75446 220 aa9.44□□□□□ -0.9
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