RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489639.1

MFSD1-217, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-217ENST00000489639 FAM223AQ8IWN6 122 aa4.95□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 OR5T1Q8NG75 326 aa4.95□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.95□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.95□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 MANBALQ9NQG1 85 aa4.95□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 YAE1D1Q9NRH1 226 aa4.95□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 TMEM160Q9NX00 188 aa4.95□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 C21orf62Q9NYP8 219 aa4.95□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 FBXL7Q9UJT9 491 aa4.95□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 FUT9Q9Y231 359 aa4.95□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 A0A1B0GV50 99 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 TMEM218A2RU14 115 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 TMEM89A2RUT3 159 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 HYPMO75409 117 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 OR2J3O76001 311 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 NDUFB8O95169 186 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 TOMM40O96008 361 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 IGHV3-48P01763 117 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 RD3LP0DJH9 198 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 BCL2P10415 239 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 S100A7P31151 101 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 PLP1P60201 277 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 ZNF90Q03938 601 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 ATP5G2Q06055 141 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 GCSAMLQ5JQS6 135 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 FAM209BQ5JX69 171 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 C10orf113Q5VZT2 155 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 SSX7Q7RTT5 188 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 PRSS22Q9GZN4 317 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 GNG13Q9P2W3 67 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 VAX2Q9UIW0 290 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 TNCP24821 2201 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 PDZD2O15018 2839 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 CR1P17927 2039 aa4.94□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 MED13LQ71F56 2210 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 F8P00451 2351 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 APCP25054 2843 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 WNK2Q9Y3S1 2297 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 PSMB11A5LHX3 300 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 LINC01548A6NM66 108 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 G3V318 75 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 IGKV1-17P01599 117 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 SFTA3P0C7M3 94 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 STAG3L2P0CL84 134 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 STAG3L3P0CL85 134 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 C8orf88P0DMB2 117 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 GCHFRP30047 84 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 ICAM4Q14773 271 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 HAGHQ16775 308 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 C15orf32Q32M92 178 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 TIGITQ495A1 244 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 Q56UQ5 140 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 FAM78BQ5VT40 261 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 STXBP6Q8NFX7 210 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 OR51G1Q8NGK1 321 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 ZNF502Q8TBZ5 544 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 SUN5Q8TC36 379 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 USMG5Q96IX5 58 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 TXNDC17Q9BRA2 123 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 SEC11CQ9BY50 192 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 SLC35B3Q9H1N7 401 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 RNF24Q9Y225 148 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 HIGD1AQ9Y241 93 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 TACC2O95359 2948 aa4.93□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 ITPR2Q14571 2701 aa4.92□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.92□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 CELSR2Q9HCU4 2923 aa4.92□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 A0A0G2JLM5 398 aa4.92□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa4.92□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 F8W036 122 aa4.92□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 TMEM250H0YL14 139 aa4.92□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 OR7C2O60412 319 aa4.92□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 OR2C1O95371 312 aa4.92□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 TRGV3P03979 118 aa4.92□□□□□ -1.62
MFSD1-217ENST00000489639 ARL14EPLP0DKL9 152 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms