RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 RFPL4AA6NLU0 287 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 M0R135 149 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MYL12BO14950 172 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 UPK1BO75841 260 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 GCGP01275 180 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHV3-7P01780 117 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 IGLV7-43P04211 117 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 GYPBP06028 91 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CD14P08571 375 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 COX4I1P13073 169 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 IFI30P13284 250 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CD34P28906 385 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 HSPA13P48723 471 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 LSM6P62312 80 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RUNX1Q01196 453 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PRKCDQ05655 676 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PRDX4Q13162 271 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 SPIN3Q5JUX0 258 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM131AQ6UXB0 335 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 VTCN1Q7Z7D3 282 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFB125Q8N687 156 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PACRGLQ8N7B6 248 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00469Q8N7U9 141 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 OR4X2Q8NGF9 303 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 OR51L1Q8NGJ5 315 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 OR11L1Q8NGX0 322 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10Z1Q8NGY1 313 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2T27Q8NH04 317 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 OR52N1Q8NH53 320 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 OR1S1Q8NH92 325 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RPS4Y2Q8TD47 263 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM239Q8WW34 195 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 LZICQ8WZA0 190 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MALSU1Q96EH3 234 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 NMNAT3Q96T66 252 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 VCX3BQ9H321 246 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 ARMC1Q9NVT9 282 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CD300AQ9UGN4 299 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 VAX2Q9UIW0 290 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1B0GTI1 187 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PNN7 141 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 DHRS12A0PJE2 317 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 A6NIN4 97 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 BHLHE40O14503 412 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 OVOL1O14753 267 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MRASO14807 208 aa1.55□□□□□ -2.16
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RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFA2O43678 99 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 GMDSO60547 372 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV1D-12P01611 117 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PFN1P07737 140 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RPSAP08865 295 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF728P0DKX0 622 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PRSS3P35030 304 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 GABRA2P47869 451 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 NUDT2P50583 147 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 BCAP31P51572 246 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 HCCSP53701 268 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM11AP58511 58 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 NCALDP61601 193 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL31P62899 125 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 GRB2P62993 217 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 SELENOWP63302 87 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 FLOT2Q14254 428 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 HLA-DRB5Q30154 266 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 LGALS9CQ6DKI2 356 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa1.55□□□□□ -2.16
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RABGGTB-211ENST00000489450 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 DHFR2Q86XF0 187 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 ANGPTL5Q86XS5 388 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PDPNQ86YL7 162 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CYB561A3Q8NBI2 242 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 OR8B12Q8NGG6 310 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 OR4K13Q8NH42 304 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 C4orf3Q8WVX3 66 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 BAALCQ8WXS3 180 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM106AQ96A25 262 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 REEP6Q96HR9 211 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 Q96MT0 163 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 PITX2Q99697 317 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 CHST6Q9GZX3 395 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-211ENST00000489450 HDHD2Q9H0R4 259 aa1.55□□□□□ -2.16
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