RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483062.5

SYN3-212, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 3

Gene SYN3, Length 827 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-212ENST00000483062 ATP6V1FQ16864 119 aa5.89□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 C15orf32Q32M92 178 aa5.89□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 SPINK9Q5DT21 86 aa5.89□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.89□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.89□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 SLC35E1Q96K37 410 aa5.89□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.89□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.89□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 MT-CO2P00403 227 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 S100A7P31151 101 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 RELQ04864 619 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 RAB31Q13636 194 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 RPEL1Q2QD12 228 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 S100A7AQ86SG5 101 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 OR4X1Q8NH49 305 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 PEMTQ9UBM1 199 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 C15orf62A8K5M9 175 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 I3L2K1 104 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 GNG7O60262 68 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 GGCTO75223 188 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 CCNKO75909 580 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 NDUFB8O95169 186 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 PRH1P02810 166 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 CLEC3BP05452 202 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 CXCL3P19876 107 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 SULT1A1P50225 295 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 DLK1P80370 383 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 Q56UQ5 140 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 CXorf65A6NEN9 183 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 ZNF785A8K8V0 405 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 K7EIM0 57 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 LGALS9O00182 355 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 MPDU1O75352 247 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 CLN5O75503 358 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 DFFBO76075 338 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 BMI1P35226 326 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 ARL3P36405 182 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 PAX9P55771 341 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 ZNF546Q86UE3 836 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 AKAP14Q86UN6 197 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 LILRB2Q8N423 598 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 DEFB125Q8N687 156 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 OR1S2Q8NGQ3 325 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 RNF24Q9Y225 148 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 C2orf70A6NJV1 201 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 A8MWP6 167 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 H3BP45 60 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 TGOLN2O43493 480 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 IFNA5P01569 189 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 CD7P09564 240 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 C4BPBP20851 252 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 MFAP2P55001 183 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 CD81P60033 236 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 SELENOTP62341 195 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 AKR1C1Q04828 323 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 PMS2P11Q13670 270 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 TMEM144Q7Z5S9 345 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 GPHB5Q86YW7 130 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 Q8WTZ3 238 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 NPIPB3Q92617 1050 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-212ENST00000483062 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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