RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM25CB3EWG5 89 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM25GB3EWG6 89 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 B3GALNT1O75752 331 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 TOMM40O96008 361 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV3-20P01619 116 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 CD74P04233 296 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5AC1P0C628 307 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 RD3LP0DJH9 198 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 MEF2DQ14814 521 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR146Q96CH1 333 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 ABHD1Q96SE0 405 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 NEU1Q99519 415 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM189A5PLL7 270 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB3DO95716 219 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 IFNA21P01568 189 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 PSG1P11464 419 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 FXYD7P58549 80 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF709Q8N972 641 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM210BQ96KR6 192 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 NAA60Q9H7X0 242 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 DKK2Q9UBU2 259 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 RFNGQ9Y644 331 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 TNFAIP8O95379 198 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 HTN3P15516 51 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 RORCP51449 518 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 TAS2R19P59542 299 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 NMSQ5H8A3 153 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 Q5VSD8 79 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 MZT2AQ6P582 158 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF125Q96EQ8 232 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00052Q96N35 136 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 SOCS3O14543 225 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP10-2P60368 255 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF79Q15937 498 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR107Q5VW38 600 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 NOXA1Q86UR1 476 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 AP3S1Q92572 193 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 GABARAPH6UMI1 98 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 J3QL48 77 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 GABARAPO95166 117 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 ID1P41134 155 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 PSMB3P49720 205 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF90Q03938 601 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF212Q495C1 297 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 COQ8AQ8NI60 647 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 PRR13Q9NZ81 148 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.65□□□□□ -1.34
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