RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 FAM110AQ9BQ89 295 aa15.58■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 FAM25EA8MYX2 175 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 P2RY1P47900 373 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 OR51G1Q8NGK1 321 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 RAB40CQ96S21 281 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 TRGV9Q99603 122 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 MS4A6AQ9H2W1 248 aa15.57■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 STAB2Q8WWQ8 2551 aa15.56■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R30P59541 319 aa15.56■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 PAFAH1B2P68402 229 aa15.56■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa15.56■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 RNF125Q96EQ8 232 aa15.56■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 SPATA25Q9BR10 227 aa15.56■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 C5orf51A6NDU8 294 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 CCNKO75909 580 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 C16orf54Q6UWD8 224 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 WFDC3Q8IUB2 231 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 GRAMD2BQ96HH9 432 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 C2orf50Q96LR7 162 aa15.55■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 TRAV2A0A0B4J234 112 aa15.54■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 C7orf66A4D0T2 115 aa15.54■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.54■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 TSC22D2O75157 780 aa15.54■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 DEFA1P59665 94 aa15.54■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 DEFA3P59666 94 aa15.54■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 RPL11P62913 178 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 IL15RAQ13261 267 aa15.54■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 OR8G2PQ6IF36 304 aa15.54■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 GLMPQ8WWB7 406 aa15.54■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 GGTLC1Q9BX51 225 aa15.54■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 RABAC1Q9UI14 185 aa15.54■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 TENM3Q9P273 2699 aa15.54■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 K7EPK0 472 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 BUB3O43684 328 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 FABP1P07148 127 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 METTL15P1P0C7V9 234 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 OR2F1Q13607 317 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 APRG1Q8IVJ8 170 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 MARVELD1Q9BSK0 173 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 PBDC1Q9BVG4 233 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 MAP6D1Q9H9H5 199 aa15.53■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 SNRPGP15A8MWD9 76 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 ZNF124Q15973 351 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 GSG1LQ6UXU4 331 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 TMEM144Q7Z5S9 345 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 FAM24BQ8N5W8 94 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 C11orf1Q9H5F2 150 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 RETNQ9HD89 108 aa15.52■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
ACTB-211ENST00000480301 HELTA6NFD8 242 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 PRAF2O60831 178 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 LYZP61626 148 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 DLK1P80370 383 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 AKR1C1Q04828 323 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 STPG3Q8N7X2 389 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 STXBP6Q8NFX7 210 aa15.51■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 K7EQG2 157 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 L7N2F9 121 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 VAMP2P63027 116 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 ARL16Q0P5N6 197 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 OR10P1Q8NGE3 313 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 DCANP1Q8TF63 244 aa15.5■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 SMCO3A2RU48 225 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 CFDP00746 253 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 FNDC10F2Z333 226 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 RAB32Q13637 225 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 SIX6O95475 246 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 DEFB131AP59861 70 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 BPIFCQ8NFQ6 507 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 NPVFQ9HCQ7 196 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 PFDN2Q9UHV9 154 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 FAM24AA6NFZ4 105 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 GOSR2O14653 212 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 DEDDO75618 318 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 APOC4P55056 127 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 S100A10P60903 97 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DL5AQ8N109 375 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 GGACTQ9BVM4 153 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 EDA2RQ9HAV5 297 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-211ENST00000480301 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa15.46■□□□□ 0.06
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