RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 RFNGQ9Y644 331 aa5.96□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.96□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SMIM9A6NGZ8 99 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 C16orf90A8MZG2 172 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 IL4P05112 153 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 OR10J1P30954 320 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 AKR1C2P52895 323 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM88Q6PEY1 159 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 LHFPL1Q86WI0 220 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 CROCCP3Q8IVE0 287 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF709Q8N972 641 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 FAM210BQ96KR6 192 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 LINC00052Q96N35 136 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SLC35B3Q9H1N7 401 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 ENY2Q9NPA8 101 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 NRN1Q9NPD7 142 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 COMMD3Q9UBI1 195 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 KLK11Q9UBX7 282 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM189A5PLL7 270 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 C9orf118A6NHY6 69 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 F6UB75 175 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 PAX4O43316 350 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 CDK2AP2O75956 126 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 RD3LP0DJH9 198 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 PSG1P11464 419 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 ELK1P19419 428 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 UCP1P25874 307 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 RCVRNP35243 200 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SPCS3P61009 180 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM16LQ309B1 348 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 AARDQ4LEZ3 155 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 C2orf83Q53S99 150 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 OR4B1Q8NGF8 309 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 OR4D10Q8NGI6 311 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 GPR146Q96CH1 333 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 YIPF6Q96EC8 236 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 PDCD10Q9BUL8 212 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SCPEP1Q9HB40 452 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SOCS3O14543 225 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 HPGDSO60760 199 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 TOMM40O96008 361 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 CD3DP04234 171 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SLC25A4P12235 298 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 HTR2BP41595 481 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 MEF2DQ14814 521 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 OXA1LQ15070 435 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF79Q15937 498 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 Q8N1X5 172 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 OR52E5Q8NH55 327 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SVIPQ8NHG7 77 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 ACY3Q96HD9 319 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 ATG12O94817 140 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 CDS2O95674 445 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 APOA1P02647 267 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 OR5AC1P0C628 307 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 PSG9Q00887 426 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF90Q03938 601 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 FCN2Q15485 313 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 FAM78BQ5VT40 261 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 OR13C8Q8NGS7 320 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 OR52I2Q8NH67 350 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 TERB2Q8NHR7 220 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 C20orf173Q96LM9 149 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 C17orf77Q96MU5 243 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 COPZ2Q9P299 210 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0J9YX75 114 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 CEBPZOSA8MTT3 80 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 SCGB2A1O75556 95 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-208ENST00000479480 HBE1P02100 147 aa5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms