RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 TMEM50AO95807 157 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 SCGB1D2O95969 90 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 FABP1P07148 127 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 BMI1P35226 326 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 VAMP2P63027 116 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 GINS3Q9BRX5 216 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 NMES1Q9C002 83 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 CCSO14618 274 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 MBPP02686 304 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 RLN2P04090 185 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 ST8SIA2Q92186 375 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 FNDC10F2Z333 226 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 GOSR2O14653 212 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 PET100P0DJ07 73 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 RND2P52198 227 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 IL15RAQ13261 267 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 DEFB135Q30KP9 77 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 ASB13Q8WXK3 278 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 OR4C46A6NHA9 309 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 K7EPK0 472 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 DFFBO76075 338 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 CFDP00746 253 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 CD5P06127 495 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 OR10J1P30954 320 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 TCF24Q7RTU0 167 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 FAM24BQ8N5W8 94 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 Q8WTZ3 238 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 GGACTQ9BVM4 153 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 A0A0J9YWU9 116 aa9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 IGLC1P0CG04 106 aa9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 S100A7P31151 101 aa9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 PAX9P55771 341 aa9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 S100A10P60903 97 aa9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 DLK1P80370 383 aa9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 GAMTQ14353 236 aa9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 OXA1LQ15070 435 aa9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 TIGITQ495A1 244 aa9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 NPIPB3Q92617 1050 aa9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 ACY3Q96HD9 319 aa9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 TMEM231Q9H6L2 316 aa9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 ALG5Q9Y673 324 aa9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 A0A1W2PS18 150 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 ZFP92A6NM28 416 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 PRSS46E5RG02 174 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 H3BP45 60 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 SPRY2O43597 315 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 TOMM40O96008 361 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 IGKV1-17P01599 117 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 BCAP31P51572 246 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 RAB32Q13637 225 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 THAP8Q8NA92 274 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 TRGV9Q99603 122 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 MED28Q9H204 178 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 VSIRQ9H7M9 311 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 MGAT4CQ9UBM8 478 aa9.59□□□□□ -0.87
HPS1-211ENST00000478087 E5RGE8 158 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 DEDDO75618 318 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 RD3LP0DJH9 198 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 CAV2P51636 162 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 APOC4P55056 127 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 HBG1P69891 147 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 HBG2P69892 147 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 LEMD1Q68G75 181 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 Q6ZWC4 215 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 STX12Q86Y82 276 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 IL17DQ8TAD2 202 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 RNF183Q96D59 192 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 METTL26Q96S19 204 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-211ENST00000478087 METTL15P1P0C7V9 234 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.1 ms