RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 PSENENQ9NZ42 101 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 U3KQE9 123 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 MPTX1A8MV57 137 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 FNDC10F2Z333 226 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 PRAF2O60831 178 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 PSG1P11464 419 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 P2RY1P47900 373 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
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PRAME-211ENST00000476336 RNF125Q96EQ8 232 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 CITED4Q96RK1 184 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 GSKIPQ9P0R6 139 aa9.94□□□□□ -0.82
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PRAME-211ENST00000476336 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.94□□□□□ -0.82
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PRAME-211ENST00000476336 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 PRSS46E5RG02 174 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 SSSCA1O60232 199 aa9.93□□□□□ -0.82
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PRAME-211ENST00000476336 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 S100A7AQ86SG5 101 aa9.93□□□□□ -0.82
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PRAME-211ENST00000476336 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
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PRAME-211ENST00000476336 C3orf84H3BNL1 204 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 BUB3O43684 328 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 SCGB1D2O95969 90 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 AKR1C1Q04828 323 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 Q6ZWC4 215 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.92□□□□□ -0.82
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PRAME-211ENST00000476336 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 RNF24Q9Y225 148 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.92□□□□□ -0.82
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PRAME-211ENST00000476336 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.91□□□□□ -0.82
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PRAME-211ENST00000476336 H3BP45 60 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 L7N2F9 121 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 TFPI2P48307 235 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 SELENOTP62341 195 aa9.91□□□□□ -0.82
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PRAME-211ENST00000476336 BPIFCQ8NFQ6 507 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 IL17DQ8TAD2 202 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 GLMPQ8WWB7 406 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 SEC22CQ9BRL7 303 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 MGAT4CQ9UBM8 478 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 K7EQG2 157 aa9.9□□□□□ -0.82
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PRAME-211ENST00000476336 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.9□□□□□ -0.82
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PRAME-211ENST00000476336 STXBP6Q8NFX7 210 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 PBDC1Q9BVG4 233 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-211ENST00000476336 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
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PRAME-211ENST00000476336 CYCSP99999 105 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 TEPPQ6URK8 271 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 MUC7Q8TAX7 377 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 DCANP1Q8TF63 244 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.89□□□□□ -0.83
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PRAME-211ENST00000476336 MARVELD1Q9BSK0 173 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 NRN1Q9NPD7 142 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 SMCO3A2RU48 225 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-211ENST00000476336 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.88□□□□□ -0.83
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