RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 CREBBPQ92793 2442 aa12.91□□□□□ -0.34
USP20-204ENST00000472108 ZFP92A6NM28 416 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-204ENST00000472108 AMY1AP04745 511 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-204ENST00000472108 C22orf15Q8WYQ4 148 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-204ENST00000472108 RAB24Q969Q5 203 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-204ENST00000472108 SRD5A3Q9H8P0 318 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-204ENST00000472108 SLC25A22Q9H936 323 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-204ENST00000472108 LINC00587B1AMM8 73 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-204ENST00000472108 CEBPGP53567 150 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-204ENST00000472108 NDUFA6P56556 154 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-204ENST00000472108 C9orf139Q6ZV77 190 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-204ENST00000472108 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
USP20-204ENST00000472108 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
USP20-204ENST00000472108 TMEM68Q96MH6 324 aa12.9□□□□□ -0.34
USP20-204ENST00000472108 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 A0A1W2PPV4 95 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 LY6EQ16553 131 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 DEFB112Q30KQ8 113 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 FANCD2OSQ96PS1 177 aa12.89□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 K7EIM0 57 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 ATP6V0E1O15342 81 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 C16orf82Q7Z2V1 217 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 TRGV9Q99603 122 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 UNC79Q9P2D8 2635 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 PDZD2O15018 2839 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 M0QZK8 103 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 PHOX2AO14813 284 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 TRGC2P03986 189 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 CD99P14209 185 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 SELENOTP62341 195 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 ZNF343Q6P1L6 599 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 HIST3H2BBQ8N257 126 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 OR5T1Q8NG75 326 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 OR4X1Q8NH49 305 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 TMUB1Q9BVT8 246 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 C19orf24Q9BVV8 132 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 TNFRSF19Q9NS68 423 aa12.88□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 LINC01548A6NM66 108 aa12.87□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 PFN1P07737 140 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 ZNF90Q03938 601 aa12.87□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa12.87□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 SMIM7Q9BQ49 75 aa12.87□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 FASNP49327 2511 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 IFITM10A6NMD0 228 aa12.86□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 RHOBP62745 196 aa12.86□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 KLK9Q2XQG4 91 aa12.86□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 PYY3Q5JQD4 70 aa12.86□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 IMMP2LQ96T52 175 aa12.86□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 THYN1Q9P016 225 aa12.86□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 KLK9Q9UKQ9 250 aa12.86□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa12.86□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 CCDC168Q8NDH2 2452 aa12.86□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 CSMD1Q96PZ7 3565 aa12.86□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 TRGC1P0CF51 173 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 SRP14P37108 136 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 IER3P46695 156 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 ECSCRQ19T08 205 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 OR5B12Q96R08 314 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 PFDN5Q99471 154 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 ZANQ9Y493 2812 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 PDE6DO43924 150 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 TYMSP04818 313 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 OR51G1Q8NGK1 321 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 PSMB11A5LHX3 300 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 IGHV4-59P01825 116 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 IGLC1P0CG04 106 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 STAG3L2P0CL84 134 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 STAG3L3P0CL85 134 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 OR5R1Q8NH85 324 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 ITPR3Q14573 2671 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 ITPR2Q14571 2701 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 G3V318 75 aa12.83□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 IGHG2P01859 326 aa12.83□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 OR5G3P0C626 314 aa12.83□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 FAM78BQ5VT40 261 aa12.83□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 Q6YL49 198 aa12.83□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 TMEM183AQ8IXX5 376 aa12.83□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 TEX29Q8N6K0 151 aa12.83□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 GATAD1Q8WUU5 269 aa12.83□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 TMEM37Q8WXS4 190 aa12.83□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 FRZBQ92765 325 aa12.83□□□□□ -0.35
USP20-204ENST00000472108 PRDM13Q9H4Q3 707 aa12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms