RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-205ENST00000468371 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1-205ENST00000468371 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SHQ1-205ENST00000468371 CT45A6P0DMU7 189 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1-205ENST00000468371 CT45A5P0DMU8 189 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1-205ENST00000468371 CT45A7P0DMV0 189 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1-205ENST00000468371 PAX8Q06710 450 aa4.84□□□□□ -1.63
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