RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 RD3LP0DJH9 198 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 IL7P13232 177 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 NMSQ5H8A3 153 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 DCANP1Q8TF63 244 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 S100ZQ8WXG8 99 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 CACFD1Q9UGQ2 172 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 ZFP92A6NM28 416 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 TOMM40O96008 361 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 IAPPP10997 89 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 PSG1P11464 419 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 GLMPQ8WWB7 406 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 MFFQ9GZY8 342 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 U3KQ87 197 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 U3KQE9 123 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 NDUFB6O95139 128 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 SPP1P10451 314 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 C4BPBP20851 252 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 RNF125Q96EQ8 232 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 SLC35E1Q96K37 410 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 CCDC32Q9BV29 185 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF90Q03938 601 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 OR2F1Q13607 317 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 RAB40CQ96S21 281 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf3-212ENST00000468164 KMT2AQ03164 3969 aa9.78□□□□□ -0.84
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C9orf3-212ENST00000468164 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 LYRM1O43325 122 aa9.77□□□□□ -0.85
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C9orf3-212ENST00000468164 DEDDO75618 318 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 SFT2D2O95562 160 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 HOXB5P09067 269 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 LYZP61626 148 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 PPP1R1AQ13522 171 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 GAMTQ14353 236 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 NRN1Q9NPD7 142 aa9.77□□□□□ -0.85
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C9orf3-212ENST00000468164 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 RAB11AP62491 216 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF846Q147U1 533 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 C4orf46Q504U0 113 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 Q8NAQ8 132 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00052Q96N35 136 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 XCL2Q9UBD3 114 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 IGLL5B9A064 214 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 WRBO00258 174 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 FABP1P07148 127 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 MIFP14174 115 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 DEFB1P60022 68 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 MZT2BQ6NZ67 158 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 COQ8AQ8NI60 647 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 TMED3Q9Y3Q3 217 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 C9orf170A2RU37 121 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 SNRPGP15A8MWD9 76 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 H3BP45 60 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 PLA2G10O15496 165 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 MED6O75586 246 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 HLA-DMBP28068 263 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 FXYD7P58549 80 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 LRTM2Q8N967 370 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-212ENST00000468164 X6R8D5 127 aa9.74□□□□□ -0.85
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