RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462421.1

DDX39B-216, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-216ENST00000462421 BSXQ3C1V8 233 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.7□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 PSENENQ9NZ42 101 aa6.7□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 SORL1Q92673 2214 aa6.69□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 SSSCA1O60232 199 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 IGLC1P0CG04 106 aa6.69□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 DEFB131AP59861 70 aa6.69□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.69□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 RNF125Q96EQ8 232 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 RAB40CQ96S21 281 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.69□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 CSTL1Q9H114 145 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 CXorf65A6NEN9 183 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 SPP1P10451 314 aa6.68□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.68□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 RETNQ9HD89 108 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 NRN1Q9NPD7 142 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 H3BP45 60 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 RLN2P04090 185 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 TCRBP04435 133 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 IL5P05113 134 aa6.67□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 PSMG4Q5JS54 123 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 STX12Q86Y82 276 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 LILRB2Q8N423 598 aa6.67□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 GPR82Q96P67 336 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 TRGV9Q99603 122 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 BATF3Q9NR55 127 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 NUDT15Q9NV35 164 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 NUPR2A6NF83 97 aa6.66□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 IGKV1-17P01599 117 aa6.66□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 SELENOTP62341 195 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.66□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 LEMD1Q68G75 181 aa6.66□□□□□ -1.34
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DDX39B-216ENST00000462421 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 MITD1Q8WV92 249 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 LINC00052Q96N35 136 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 RARRES2Q99969 163 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 MFFQ9GZY8 342 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 SLC25A22Q9H936 323 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-216ENST00000462421 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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