RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF90Q03938 601 aa5.19□□□□□ -1.58
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RABGEF1-206ENST00000461017 TCF24Q7RTU0 167 aa5.19□□□□□ -1.58
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RABGEF1-206ENST00000461017 ACY3Q96HD9 319 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 U3KQ87 197 aa5.19□□□□□ -1.58
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RABGEF1-206ENST00000461017 NPPCP23582 126 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 P2RY1P47900 373 aa5.17□□□□□ -1.58
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RABGEF1-206ENST00000461017 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.17□□□□□ -1.58
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZMAT4Q9H898 229 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT15Q9NV35 164 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 PSENENQ9NZ42 101 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
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RABGEF1-206ENST00000461017 MED6O75586 246 aa5.16□□□□□ -1.58
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RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB131AP59861 70 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 DCANP1Q8TF63 244 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8WTZ3 238 aa5.16□□□□□ -1.58
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RABGEF1-206ENST00000461017 C7orf66A4D0T2 115 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 K7EPK0 472 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 BUB3O43684 328 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 SIX6O95475 246 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 IFNA21P01568 189 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 IL5P05113 134 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.15□□□□□ -1.59
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RABGEF1-206ENST00000461017 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 NOXA1Q86UR1 476 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
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