RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444498.5

NME4-205, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, human

TSL 3

Gene NME4, Length 1,111 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NME4-205	ENST00000444498	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	GLMP	Q8WWB7	406 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	PRSS46	E5RG02	174 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	FABP1	P07148	127 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	DEFB131A	P59861	70 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	ZNF90	Q03938	601 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	DEFB135	Q30KP9	77 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	IL17D	Q8TAD2	202 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	DCANP1	Q8TF63	244 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	MITD1	Q8WV92	249 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	RNF125	Q96EQ8	232 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	TRGV9	Q99603	122 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	CSTL1	Q9H114	145 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	BUB3	O43684	328 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	TCRB	P04435	133 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	LEMD1	Q68G75	181 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	RNF183	Q96D59	192 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498		A6NHS1	94 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	THAP8	Q8NA92	274 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	S100Z	Q8WXG8	99 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498		H3BP45	60 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NME4-205	ENST00000444498	ZNF688	P0C7X2	276 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	SMIM8	Q96KF7	97 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	NUDT15	Q9NV35	164 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	SSSCA1	O60232	199 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	LYZ	P61626	148 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	OR2F1	Q13607	317 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	NRN1	Q9NPD7	142 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	PAX9	P55771	341 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	STH	Q8IWL8	128 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	RAB40C	Q96S21	281 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498		A0A0J9YWU9	116 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	TAS2R30	P59541	319 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	AKR1C1	Q04828	323 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	SCGB1D2	O95969	90 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	ASAH1	Q13510	395 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	PSMG4	Q5JS54	123 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	FBXL17	Q9UF56	701 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	KNCN	A6PVL3	124 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	TSC22D2	O75157	780 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	CCS	O14618	274 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	DLK1	P80370	383 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	ZNF846	Q147U1	533 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	RARRES2	Q99969	163 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NME4-205	ENST00000444498	TENM2	Q9NT68	2774 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NME4-205	ENST00000444498	LCE6A	A0A183	80 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NME4-205	ENST00000444498	SMCO3	A2RU48	225 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NME4-205	ENST00000444498	FNDC10	F2Z333	226 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NME4-205	ENST00000444498	UPK1B	O75841	260 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NME4-205	ENST00000444498	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms