RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PRAME-209ENST00000439106 ZNF90Q03938 601 aa10.14□□□□□ -0.79
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PRAME-209ENST00000439106 GGNBP1Q5YKI7 109 aa10.14□□□□□ -0.79
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PRAME-209ENST00000439106 RNF125Q96EQ8 232 aa10.14□□□□□ -0.79
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PRAME-209ENST00000439106 CENPXA8MT69 81 aa10.07□□□□□ -0.8
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PRAME-209ENST00000439106 AKR1C1Q04828 323 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 GDF5OSQ5U4N7 250 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 OR8G2PQ6IF36 304 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 PPP1R14BQ96C90 147 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 C20orf85Q9H1P6 137 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 FBXL17Q9UF56 701 aa10.07□□□□□ -0.8
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PRAME-209ENST00000439106 SNRPGP15A8MWD9 76 aa10.06□□□□□ -0.8
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PRAME-209ENST00000439106 LYRM1O43325 122 aa10.06□□□□□ -0.8
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PRAME-209ENST00000439106 TMEM217Q8N7C4 229 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 Q8NAQ8 132 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 LINC00476Q8WZB0 136 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 PSENENQ9NZ42 101 aa10.06□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 TRAV6A0A075B6T7 132 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 PMS2P5A8MQ11 134 aa10.05□□□□□ -0.8
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