RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RETNQ9HD89 108 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 K7EMT4 169 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SSNA1O43805 119 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TSC22D2O75157 780 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DFFBO76075 338 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CST7O76096 145 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LYZP61626 148 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FCN2Q15485 313 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MARC2Q969Z3 335 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NEURL2Q9BR09 285 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VSIRQ9H7M9 311 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 L7N2F9 121 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DEDDO75618 318 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 P2RY1P47900 373 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BCAP31P51572 246 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CAV2P51636 162 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VAMP2P63027 116 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TCF24Q7RTU0 167 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NOXA1Q86UR1 476 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GLMPQ8WWB7 406 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RNF125Q96EQ8 232 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAB40CQ96S21 281 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRGV9Q99603 122 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 B9D2Q9BPU9 175 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GINS3Q9BRX5 216 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DOK5Q9P104 306 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 U3KQE9 123 aa7.02□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TSPAN4O14817 238 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RD3LP0DJH9 198 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CRYBB3P26998 211 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DLK1P80370 383 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 METTL26Q96S19 204 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MGST2Q99735 147 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MBD2Q9UBB5 411 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TAS2R30P59541 319 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DEFB1P60022 68 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OXA1LQ15070 435 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RGS21Q2M5E4 152 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LEMD1Q68G75 181 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C16orf54Q6UWD8 224 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 APRG1Q8IVJ8 170 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM252Q8N6L7 170 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STXBP6Q8NFX7 210 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 Q8WTZ3 238 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SCRT1Q9BWW7 348 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NMES1Q9C002 83 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR11H12B2RN74 326 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SCGB2A1O75556 95 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LINC00869P0C866 280 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NPPCP23582 126 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NHLH2Q02577 135 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 Q5BKY6 102 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MORN5Q5VZ52 161 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C17orf77Q96MU5 243 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms