RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa22.72■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 SLC38A11Q08AI6 406 aa22.72■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 OR2T35Q8NGX2 323 aa22.72■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa22.72■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 SMLR1H3BR10 107 aa22.72■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 PET100P0DJ07 73 aa22.72■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 STX12Q86Y82 276 aa22.72■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 OR2K2Q8NGT1 345 aa22.72■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 NPVFQ9HCQ7 196 aa22.72■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 IL4P05112 153 aa22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 PRR25Q96S07 402 aa22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 MBD2Q9UBB5 411 aa22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-202ENST00000401498 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 CHEK1O14757 476 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 APOHP02749 345 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 OR51G1Q8NGK1 321 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 NHLH2Q02577 135 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 OR2F1Q13607 317 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 LCN12Q6JVE5 192 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 AKAP14Q86UN6 197 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 SLC25A31Q9H0C2 315 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 FABP1P07148 127 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 LYL1P12980 280 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 GP9P14770 177 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 NPPCP23582 126 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 S100A11P31949 105 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 CD300CQ08708 224 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM61Q8N0U2 210 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 METTL26Q96S19 204 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 CRYBB3P26998 211 aa22.67■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 FGL1Q08830 312 aa22.67■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 RNF125Q96EQ8 232 aa22.67■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 HBG1P69891 147 aa22.67■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 HBG2P69892 147 aa22.67■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 TEPPQ6URK8 271 aa22.67■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 ST8SIA2Q92186 375 aa22.67■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 RNF2Q99496 336 aa22.67■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 VSIRQ9H7M9 311 aa22.67■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF785A8K8V0 405 aa22.66■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 VWC2Q2TAL6 325 aa22.66■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 TCTE3Q8IZS6 198 aa22.66■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 LILRB2Q8N423 598 aa22.66■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa22.65■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 K7EIL1 84 aa22.65■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 THAP6Q8TBB0 222 aa22.65■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 NEURL2Q9BR09 285 aa22.65■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 UQCC1Q9NVA1 299 aa22.65■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 U3KQE9 123 aa22.65■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa22.64■■□□□ 1.22
PKDCC-202ENST00000401498 BAXQ07812 192 aa22.63■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 ATP6V1FQ16864 119 aa22.63■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 OR5C1Q8NGR4 320 aa22.63■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 PBDC1Q9BVG4 233 aa22.63■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM147Q9BVK8 224 aa22.63■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 TRAV25A0A0B4J276 109 aa22.63■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 LYZP61626 148 aa22.63■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 RPL12P30050 165 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 BPIFCQ8NFQ6 507 aa22.62■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 RABAC1Q9UI14 185 aa22.62■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PS18 150 aa22.61■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 CFDP00746 253 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 GUCA2BQ16661 112 aa22.61■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 FAM90A2PQ658T7 463 aa22.61■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 MGST2Q99735 147 aa22.61■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 WDR83OSQ9Y284 106 aa22.61■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 AGPAT2O15120 278 aa22.6■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 BMI1P35226 326 aa22.6■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa22.6■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 TSPAN4O14817 238 aa22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 DFFBO76075 338 aa22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 SELENOTP62341 195 aa22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 STPG3Q8N7X2 389 aa22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 OR11H4Q8NGC9 324 aa22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 HSPB11Q9Y547 144 aa22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 CLINT1Q14677 625 aa22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM231Q9H6L2 316 aa22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 SLC45A2Q9UMX9 530 aa22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PKDCC-202ENST00000401498 TCF24Q7RTU0 167 aa22.58■■□□□ 1.2
PKDCC-202ENST00000401498 Q8N1Y9 231 aa22.58■■□□□ 1.2
PKDCC-202ENST00000401498 MRAPQ8TCY5 172 aa22.58■■□□□ 1.2
PKDCC-202ENST00000401498 BUB3O43684 328 aa22.57■■□□□ 1.2
PKDCC-202ENST00000401498 LINC00869P0C866 280 aa22.56■■□□□ 1.2
PKDCC-202ENST00000401498 ORM2P19652 201 aa22.56■■□□□ 1.2
PKDCC-202ENST00000401498 CAMLGP49069 296 aa22.56■■□□□ 1.2
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