RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384525.1

RNU6-1117P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1117, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1117P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CCL1P22362 96 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PPIBP23284 216 aaKnown RBP-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HIST1H2BOP23527 126 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HIST1H2BBP33778 126 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HIST1H2BDP58876 126 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HIST1H2BCP62807 126 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HIST2H2BEQ16778 126 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP-3.81□□□□□ -3.02
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RNU6-1117P-201ENST00000384525 IFT81Q8WYA0 676 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HIST1H2BHQ93079 126 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HIST1H2BNQ99877 126 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HIST1H2BMQ99879 126 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BCL2L10Q9HD36 194 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TMEM94Q12767 1356 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ARHGEF11O15085 1522 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 COL24A1Q17RW2 1714 aa-3.81□□□□□ -3.02
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RNU6-1117P-201ENST00000384525 MPC1LP0DKB6 136 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PEX19P40855 299 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ATP5J2P56134 94 aa-3.82□□□□□ -3.02
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RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR5AS1Q8N127 324 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DDI1Q8WTU0 396 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TTC41PQ6P2S7 1318 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-3.82□□□□□ -3.02
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RNU6-1117P-201ENST00000384525 KIF15Q9NS87 1388 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 A0A0J9YY10 115 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 A0A1B0GX78 115 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DEKP35659 375 aaKnown RBP-3.83□□□□□ -3.02
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RNU6-1117P-201ENST00000384525 C1orf194Q5T5A4 169 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LINC00299Q6ZSB3 139 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 AHSA2Q719I0 299 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 C5orf56Q8N8D9 126 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GDPD1Q8N9F7 314 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR5D14Q8NGL3 314 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 AGR3Q8TD06 166 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PBOV1Q9GZY1 135 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 KIAA0232Q92628 1395 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa-3.84□□□□□ -3.02
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RNU6-1117P-201ENST00000384525 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MAP3K7CLP57077 242 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 EDDM3AQ14507 147 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 EXO5Q9H790 373 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PRO0255Q9UI72 69 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ERGIC3Q9Y282 383 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PXMP4Q9Y6I8 212 aa-3.84□□□□□ -3.02
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RNU6-1117P-201ENST00000384525 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
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RNU6-1117P-201ENST00000384525 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 A0A0J9YY99 117 aa-3.85□□□□□ -3.03
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RNU6-1117P-201ENST00000384525 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 C7orf71A4D174 169 aa-3.85□□□□□ -3.03
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RNU6-1117P-201ENST00000384525 C8orf74Q6P047 294 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP-3.85□□□□□ -3.03
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RNU6-1117P-201ENST00000384525 GGACTQ9BVM4 153 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CLEC2DQ9UHP7 191 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 C15orf41Q9Y2V0 281 aa-3.85□□□□□ -3.03
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RNU6-1117P-201ENST00000384525 LAMA1P25391 3075 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GOLGA8MH3BSY2 632 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP-3.86□□□□□ -3.03
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RNU6-1117P-201ENST00000384525 GUK1Q16774 197 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 Q5XG85 94 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FOXI2Q6ZQN5 318 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR52R1Q8NGF1 315 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR13C4Q8NGS5 318 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CNFNQ9BYD5 112 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TMEM14BQ9NUH8 114 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 EURLQ9NYK6 297 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DNHD1Q96M86 4753 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CLDN8P56748 225 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FABP9Q0Z7S8 132 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CDRT4Q8N9R6 151 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OSTCQ9NRP0 149 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-1117P-201ENST00000384525 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-3.87□□□□□ -3.03
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