RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM14CQ9P0S9 112 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 CITO14578 2027 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A0D9SG42 100 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1orf196B1AJZ1 125 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 GADD45GO95257 159 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 DHFRP00374 187 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 SERPINA6P08185 405 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 C12orf74Q32Q52 190 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLAMF6Q96DU3 332 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 TAS2R7Q9NYW3 318 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 UNC13CQ8NB66 2214 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 M0R036 132 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUPR1O60356 82 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 HOXA6P31267 233 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 DYNLT1P63172 113 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 GDPD1Q8N9F7 314 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLPP5Q8NEB5 264 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR11H6Q8NGC7 330 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2T10Q8NGZ9 312 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM254Q8TBM7 123 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 CT55Q8WUE5 264 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 C2orf50Q96LR7 162 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRRT1Q99946 306 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 NIT2Q9NQR4 276 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A087WUJ7 227 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 hADV38S2A0JD32 116 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 A8MT66 165 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMIM17P0DL12 118 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 SRIP30626 198 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 RHOBP62745 196 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 IMPG1Q17R60 797 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPINK9Q5DT21 86 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC00575Q6W349 94 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR6V1Q8N148 313 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC30A7Q8NEW0 376 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2T35Q8NGX2 323 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC00052Q96N35 136 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRADC1Q9BSG0 188 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM133Q9H2Q1 129 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 C14orf105Q9NVL8 296 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 ORMDL1Q9P0S3 153 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 MUC4Q99102 2169 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCPQ6ZWJ8 1503 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 M0R378 163 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 TIMM17BO60830 172 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGLV3-1P01715 115 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 SERPINE1P05121 402 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPIBP23284 216 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 DEFA3P59666 94 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q6Q795 121 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC25A40Q8TBP6 338 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 BORCS7Q96B45 105 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPER1Q99527 375 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 PSTPIP2Q9H939 334 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNF122Q9H9V4 155 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 UCK1Q9HA47 277 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 UQCC1Q9NVA1 299 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLAC8Q9NZF1 115 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBXO5Q9UKT4 447 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 MYH10P35580 1976 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 TET1Q8NFU7 2136 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNS3Q68CZ2 1445 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCN8AQ9UQD0 1980 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 K7EIL1 84 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 CYB5BO43169 146 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 C8GP07360 202 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 AP3S2P59780 193 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRINAQ7Z429 371 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR52L1Q8NGH7 329 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM172AQ8WUF8 416 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 TVP23BQ9NYZ1 205 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNFSF18Q9UNG2 199 aa0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms