RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MFSD11O43934 449 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HBQ1P09105 142 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STAG3L1P0CL83 205 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PYYP10082 97 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GTF2F2P13984 249 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRABP1P29762 137 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SULT1A1P50225 295 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IL2P60568 153 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HSF2Q03933 536 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIF1AQ16665 826 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UGT3A2Q3SY77 523 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXO48Q5FWF7 155 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NIPAL3Q6P499 406 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ENHOQ6UWT2 76 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM91Q6ZNR0 172 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNRGQ8N5I3 272 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDILTQ8N807 584 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SFT2D1Q8WV19 159 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SELENOMQ8WWX9 145 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM234Q8WY98 164 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR52E6Q96RD3 313 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPCSQ9HAB8 311 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PGAP2Q9UHJ9 254 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATPIF1Q9UII2 106 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 B9D1Q9UPM9 204 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CFTRP13569 1480 aa-5.02□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A0A6YYD4 124 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A0D9SEW6 157 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 F8W1H4 67 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 J3QRK9 145 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSMD9O00233 223 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP1R17O96001 155 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HRASP01112 189 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SERPINE2P07093 398 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GFAPP14136 432 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 F2RL1P55085 397 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q0VG73 95 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TAF13Q15543 124 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GUK1Q16774 197 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NPSR1Q6W5P4 371 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TPRG1Q6ZUI0 275 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC35E3Q7Z769 313 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC30A8Q8IWU4 369 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TEX11Q8IYF3 940 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDCL2Q8N4E4 241 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR10J6PQ8NGY7 276 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR51A7Q8NH64 312 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MITD1Q8WV92 249 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARHGDIGQ99819 225 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCT7Q99832 543 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POLR3GLQ9BT43 218 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FNDC11Q9BVV2 318 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACKR4Q9NPB9 350 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM140Q9NV12 185 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLN8Q9UBY8 286 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PZPP20742 1482 aa-5.03□□□□□ -3.21
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABCC2Q92887 1545 aa-5.03□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPLO60437 1756 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABCA6Q8N139 1617 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C17orf112F2Z3M2 114 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LSM8O95777 96 aaKnown RBP-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LIMS3P0CW19 117 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LIMS4P0CW20 117 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR13C7P0DN81 318 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAB3AP20336 220 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAB3BP20337 219 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MALP21145 153 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TAS2R50P59544 299 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNAI1P63096 354 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CARTPTQ16568 116 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BCL7AQ4VC05 210 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAHD1Q6P587 224 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR82Q6UXN9 313 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR6N1Q8NGY5 312 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRC39Q96DD0 335 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RASL10BQ96S79 203 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBA5Q9GZZ9 404 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC25A51Q9H1U9 297 aa-5.04□□□□□ -3.22
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIGUQ9H490 435 aa-5.04□□□□□ -3.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms