RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347055.3

KRCC1-201, Transcript of lysine rich coiled-coil 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRCC1, Length 1,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.64□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 K7ERU9 68 aa14.63□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 COX8AP10176 69 aa14.63□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 GP9P14770 177 aa14.63□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 IGFL2Q6UWQ7 119 aa14.63□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 OTORQ9NRC9 128 aa14.63□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.63□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.63□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 hDV102S1A0JD36 115 aa14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 CGB1A6NKQ9 187 aa14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 APOHP02749 345 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 SPRNQ5BIV9 151 aa14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 Q6AWC8 147 aa14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 CACNA1GO43497 2377 aa14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 MUC21A0A140T8X8 626 aa14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 GPR183P32249 361 aa14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF137PP52743 207 aa14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 MUC21Q5SSG8 566 aa14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 Q86TA4 180 aa14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.61□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 MC5RP33032 325 aa14.61□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 RIGQ13278 110 aa14.61□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.61□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.61□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 CCL13Q99616 98 aa14.61□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 IGHV1-46P01743 117 aa14.6□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 CSN1S1P47710 185 aa14.6□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 Q9H3A6 140 aa14.6□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 RNF24Q9Y225 148 aa14.6□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.6□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 M0R1B8 84 aa14.6□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 IGLV2-23P01705 113 aa14.6□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 LGALS7P47929 136 aa14.6□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.6□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 FAM216BQ8N7L0 139 aa14.6□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 RND1Q92730 232 aa14.6□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.6□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 OR2T8A6NH00 312 aa14.59□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 COL8A1P27658 744 aa14.59□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 PSG9Q00887 426 aa14.59□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 LINC00173Q6ZV60 143 aa14.59□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.59□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.59□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 VPS25Q9BRG1 176 aa14.59□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 AP5S1Q9NUS5 200 aa14.59□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 DYSFO75923 2080 aa14.58□□□□□ -0.07
KRCC1-201ENST00000347055 A0A1B0GUT8 65 aa14.58□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 PSG1P11464 419 aa14.58□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 HTR1DP28221 377 aa14.58□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 RNF151Q2KHN1 245 aa14.58□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 FAM201AQ5SY85 155 aa14.58□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa14.58□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 OR10AG1Q8NH19 301 aa14.58□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 BLNKQ8WV28 456 aa14.58□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 E7EUB6 86 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 CD59P13987 128 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 ORM2P19652 201 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 CEACAM3P40198 252 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 PSMG4Q5JS54 123 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 TEX45Q8NA69 505 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF747Q9BV97 191 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 MED13Q9UHV7 2174 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 DSCAMO60469 2012 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 A0A1W2PPI3 338 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 SIVA1O15304 175 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 IGLC1P0CG04 106 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 ARF6P62330 175 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.57□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 A6NDN8 102 aa14.56□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 M0QZ24 198 aa14.56□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 FAM87AP0C7U9 286 aa14.56□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 TNFRSF1AP19438 455 aa14.56□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.56□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.56□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.56□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 GAGE12BA1L429 117 aa14.55□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 H3BRM9 83 aa14.55□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.55□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa14.55□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.55□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms