RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 IGFBPL1Q8WX77 278 aa16.48■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 MBD6Q96DN6 1003 aa16.48■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 C7orf69Q9H7B7 122 aa16.48■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 NBASA2RRP1 2371 aa16.48■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFA3O95167 84 aa16.48■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 PLGLAQ15195 96 aa16.48■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM231DQ6ZW35 169 aa16.48■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 LOC105371242A0A075B767 164 aa16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1W2PPR1 153 aa16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 PAX1P15863 534 aa16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 TCL1AP56279 114 aa16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 PKIAP61925 76 aa16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 RANP62826 216 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 NBR2O15453 112 aa16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 PRTN3P24158 256 aa16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM183BQ1AE95 376 aa16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM136Q6ZRR5 245 aa16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 NPBQ8NG41 125 aa16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 BLNKQ8WV28 456 aa16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 WNT10AQ9GZT5 417 aa16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 EPDR1Q9UM22 224 aa16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 HILPDAQ9Y5L2 63 aa16.47■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 K7EIM0 57 aa16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 ESDP10768 282 aa16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 ASPHD1Q5U4P2 390 aa16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 BAGE2Q86Y30 109 aa16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM168AQ92567 244 aa16.46■□□□□ 0.23
KCNQ1-202ENST00000335475 CA1P00915 261 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 NBEAP1P0C6P0 100 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 PSG1P11464 419 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 LEMD1Q68G75 181 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 KLF12Q9Y4X4 402 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 IGKV1-17P01599 117 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 MT-ND6P03923 174 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 CRISP2P16562 243 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 SPINK4O60575 86 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCA1O95477 2261 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC35B1P78383 322 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR73Q6P4I2 378 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 CMTM2Q8TAZ6 248 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 PRO1933Q9H354 126 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 HIGD1AQ9Y241 93 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 PGPA6NDG6 321 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 CEACAM3P40198 252 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 SERTAD4Q9NUC0 356 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 IZUMO1RA6ND01 250 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 F2Z2F3 143 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB4BP61018 213 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 LYZP61626 148 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 Q0VG73 95 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 COX19Q49B96 90 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 CNIH1O95406 144 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 AMY1AP04745 511 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 CD24P25063 80 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 NUDT10Q8NFP7 164 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 NUDT11Q96G61 164 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 NAT8BQ9UHF3 227 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 TACC2O95359 2948 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 COL6A6A6NMZ7 2263 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 TSTD3H0UI37 97 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 SERF1AO75920 110 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 RPL19P84098 196 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF664Q8N3J9 261 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 C5orf17Q8NAS9 161 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 SMIM12Q96EX1 92 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 ATG101Q9BSB4 218 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 Q9H3A6 140 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 GATCO43716 136 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 DYNAPQ8N1N2 210 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 RASL11BQ9BPW5 248 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 MLST8Q9BVC4 326 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM14CQ9P0S9 112 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1W2PRD5 423 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1W2PRF3 423 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1W2PRM7 423 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 H3BTX0 84 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 C5orf64Q2M2E5 130 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 KIR3DL3Q8N743 410 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 GRAMD2BQ96HH9 432 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 DDTP30046 118 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 UBE2G1P62253 170 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 VMO1Q7Z5L0 202 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 HLA-DQA1P01909 254 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 TCRAP04437 139 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 SSTP61278 116 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 LY6DQ14210 128 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 IQCJQ1A5X6 159 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 C14orf144Q96I85 54 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 GNB4Q9HAV0 340 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF586Q9NXT0 402 aa16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms