RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PSG1P11464 419 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 FOXL1Q12952 345 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 TREML4Q6UXN2 200 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF329Q86UD4 541 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 KLHDC3Q9BQ90 382 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 C19orf67A6NJJ6 358 aa18.4■□□□□ 0.54
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PTPRM-201ENST00000332175 A8MXK9 166 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 F8VVB4 439 aa18.4■□□□□ 0.54
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PTPRM-201ENST00000332175 CRIPAKQ8N1N5 446 aa18.4■□□□□ 0.54
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PTPRM-201ENST00000332175 NCR2O95944 276 aa18.4■□□□□ 0.54
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
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PTPRM-201ENST00000332175 C20orf204Q6ZNR8 217 aa18.37■□□□□ 0.53
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PTPRM-201ENST00000332175 A0A0G2JMZ2 1700 aa18.35■□□□□ 0.53
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRM-201ENST00000332175 CRIM1Q9NZV1 1036 aa18.35■□□□□ 0.53
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PTPRM-201ENST00000332175 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRM-201ENST00000332175 Q8TAT8 98 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRM-201ENST00000332175 H0YJW9 148 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM249Q2WGJ8 235 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRM-201ENST00000332175 MDS2Q8NDY4 140 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRM-201ENST00000332175 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa18.34■□□□□ 0.53
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PTPRM-201ENST00000332175 TEX38Q6PEX7 206 aa18.33■□□□□ 0.53
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF318Q5VUA4 2279 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GWJ7 208 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF581Q9P0T4 197 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 D6R8Y8 96 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 GNB1LQ9BYB4 327 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 CST9LQ9H4G1 147 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 LYZL1Q6UWQ5 148 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 PSCAO43653 123 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRM-201ENST00000332175 PPBPP02775 128 aa18.31■□□□□ 0.52
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