RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 KNCNA6PVL3 124 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 PSG1P11464 419 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 MIFP14174 115 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 S100A5P33763 92 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 NRN1Q9NPD7 142 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 ZFP92A6NM28 416 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 DEFB4AO15263 64 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 BUB3O43684 328 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 RAB11AP62491 216 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 RNF125Q96EQ8 232 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 RAB40CQ96S21 281 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC160A6NGH7 325 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 VAMP1P23763 118 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 TCTAP57738 103 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 OR8G2PQ6IF36 304 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 HRH4Q9H3N8 390 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC9B-201ENST00000311308 C11orf94C9JXX5 98 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 MED6O75586 246 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 Q8NAQ8 132 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 TRIM63Q969Q1 353 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 SLC25A6P12236 298 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 C4BPBP20851 252 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 RPP30P78346 268 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 GAMTQ14353 236 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 TBC1D24Q9ULP9 559 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 LRTM2Q8N967 370 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.68□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 PITX3O75364 302 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 ID1P41134 155 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 PPP1R14BQ96C90 147 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.67□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 IAPPP10997 89 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 LYZP61626 148 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF90Q03938 601 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 C1orf194Q5T5A4 169 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 BATF3Q9NR55 127 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 V9GYH0 126 aa14.66□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 A6NHS1 94 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 SFT2D2O95562 160 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 TRGV9Q99603 122 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC9B-201ENST00000311308 IGLL5B9A064 214 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 H3BMM0 161 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 HLA-DRB4P13762 266 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 HLA-DMBP28068 263 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 S100A7P31151 101 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 INPP1P49441 399 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 COQ8AQ8NI60 647 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 X6R8D5 127 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 SYNGR2O43760 224 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 PPP1R1AQ13522 171 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF79Q15937 498 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 LINC00052Q96N35 136 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 XCL2Q9UBD3 114 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 KMT2AQ03164 3969 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 DEDDO75618 318 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 HOXB5P09067 269 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 PSMB3P49720 205 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 OR2F1Q13607 317 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC190Q86UF4 302 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 AGRNO00468 2067 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 WRBO00258 174 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 THAP8Q8NA92 274 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TTC9B-201ENST00000311308 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms