RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 FABP1P07148 127 aa18.61■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 RPL11P62913 178 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 PAFAH1B2P68402 229 aa18.61■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 ODF3L2Q3SX64 289 aa18.61■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 OR51G1Q8NGK1 321 aa18.61■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 C2orf50Q96LR7 162 aa18.61■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 U3KQE9 123 aa18.61■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa18.6■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 P2RY1P47900 373 aa18.6■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 OR8G2PQ6IF36 304 aa18.6■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 THAP8Q8NA92 274 aa18.6■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 GRAMD2BQ96HH9 432 aa18.6■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 TRGV9Q99603 122 aa18.6■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa18.59■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 C7orf66A4D0T2 115 aa18.59■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 PRAF2O60831 178 aa18.59■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 TSC22D2O75157 780 aa18.59■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa18.59■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 GSG1LQ6UXU4 331 aa18.59■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa18.59■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 WFDC3Q8IUB2 231 aa18.59■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 RNF125Q96EQ8 232 aa18.59■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 FAM110AQ9BQ89 295 aa18.59■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 MARVELD1Q9BSK0 173 aa18.59■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 PBDC1Q9BVG4 233 aa18.59■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 MS4A6AQ9H2W1 248 aa18.59■□□□□ 0.57
CXCL2-201ENST00000296031 PMS2P5A8MQ11 134 aa18.58■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 SNRPGP15A8MWD9 76 aa18.58■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 AKR1C1Q04828 323 aa18.58■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 CITED4Q96RK1 184 aa18.58■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 RABAC1Q9UI14 185 aa18.58■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 TENM3Q9P273 2699 aa18.58■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 STAB2Q8WWQ8 2551 aa18.57■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 CCNKO75909 580 aa18.57■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 METTL15P1P0C7V9 234 aa18.57■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 OR2F1Q13607 317 aa18.57■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa18.57■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 SPATA25Q9BR10 227 aa18.57■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa18.56■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 SMCO3A2RU48 225 aa18.56■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 K7EPK0 472 aa18.56■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 L7N2F9 121 aa18.56■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 LYZP61626 148 aa18.56■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 VAMP2P63027 116 aa18.56■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 C16orf54Q6UWD8 224 aa18.56■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 STXBP6Q8NFX7 210 aa18.56■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 TRAV2A0A0B4J234 112 aa18.55■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 IL15RAQ13261 267 aa18.55■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 OR10P1Q8NGE3 313 aa18.55■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 GGTLC1Q9BX51 225 aa18.55■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 HELTA6NFD8 242 aa18.54■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 BUB3O43684 328 aa18.54■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM144Q7Z5S9 345 aa18.54■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 APRG1Q8IVJ8 170 aa18.54■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 GLMPQ8WWB7 406 aa18.54■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 MAP6D1Q9H9H5 199 aa18.54■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 RETNQ9HD89 108 aa18.54■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 PFDN2Q9UHV9 154 aa18.54■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 CFDP00746 253 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 S100A10P60903 97 aa18.53■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 DLK1P80370 383 aa18.53■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 BCAP31P51572 246 aa18.52■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF124Q15973 351 aa18.52■□□□□ 0.56
CXCL2-201ENST00000296031 FNDC10F2Z333 226 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 GOSR2O14653 212 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 CAV2P51636 162 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 RAB32Q13637 225 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 FAM24BQ8N5W8 94 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 C11orf1Q9H5F2 150 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 MGAT4CQ9UBM8 478 aa18.51■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 K7EQG2 157 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 SIX6O95475 246 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 ARL16Q0P5N6 197 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 BPIFCQ8NFQ6 507 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 GGACTQ9BVM4 153 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 NPVFQ9HCQ7 196 aa18.5■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 DEFB131AP59861 70 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 DCANP1Q8TF63 244 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 PPP1R14BQ96C90 147 aa18.49■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 DEDDO75618 318 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 STPG3Q8N7X2 389 aa18.48■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 FAM24AA6NFZ4 105 aa18.47■□□□□ 0.55
CXCL2-201ENST00000296031 SSNA1O43805 119 aa18.47■□□□□ 0.55
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