RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MGST2Q99735 147 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 LYL1P12980 280 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf55Q5SWW7 151 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 SEC11AP67812 179 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 GBF1Q92538 1859 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 PAX8Q06710 450 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 OR5A1Q8NGJ0 315 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 TRGV9Q99603 122 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 DERL1Q9BUN8 251 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 GLRX5Q86SX6 157 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 GLMPQ8WWB7 406 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 IGKCP01834 107 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 CD177Q8N6Q3 437 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GWJ7 208 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV1-8P0DP01 117 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 SELLP14151 372 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 GFI1BQ5VTD9 330 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 RBMY1CP0DJD4 496 aa17.39■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 PSG1P11464 419 aa17.39■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 HGFACQ04756 655 aa17.39■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 OOSP1A8MZH6 123 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf63A6NC05 138 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A15Q9Y619 301 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 HSD52Q0P140 79 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 PMS2P5A8MQ11 134 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM200BQ69YZ2 307 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 TRGV11A0A075B6L2 103 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 PPIFP30405 207 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPB5A8MRT5 1133 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 TCRAP04437 139 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 Q6P435 159 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 RNF182Q8N6D2 247 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 WNT2P09544 360 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 YAE1D1Q9NRH1 226 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 MLNRO43193 412 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 OR9G4Q8NGQ1 327 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 JMJD8Q96S16 334 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM178BH3BS89 294 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP161Q6P656 301 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 CFPP27918 469 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 ASCL4Q6XD76 172 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf194Q5T5A4 169 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 GZMBP10144 247 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 PLNP26678 52 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 MED12Q93074 2177 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 GHRHP01286 108 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK11-1P61568 191 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 ACTL10Q5JWF8 245 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 RNF144BQ7Z419 303 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 STHQ8IWL8 128 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 OR2K2Q8NGT1 345 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 TDGF1P13385 188 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV41A0A0B4J266 112 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF815PA8K554 130 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 EVI2AP22794 236 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 Q0VFX4 171 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 MINOS1Q5TGZ0 78 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV3A0A0B4J244 114 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 SPOCK3Q9BQ16 436 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 SCRT1Q9BWW7 348 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00473A8K010 186 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 MDS2Q8NDY4 140 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 METRNQ9UJH8 293 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 MEGF9Q9H1U4 602 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 NTF4P34130 210 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 B3GALT5-AS1P59052 145 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 C15orf32Q32M92 178 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 DPH3Q96FX2 82 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 FNDC10F2Z333 226 aa17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 H0YJW9 148 aa17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 LAGE3Q14657 143 aa17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-201ENST00000284617 SPSB3Q6PJ21 355 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 BEND2Q8NDZ0 799 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF479Q96JC4 524 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 C15orf62A8K5M9 175 aa17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms