RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0U1RQK1 487 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF320A2RRD8 509 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 XKRY2A2RUG3 117 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM178BH3BS89 294 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 EREGO14944 169 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 GCGP01275 180 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 CT45A6P0DMU7 189 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 CT45A5P0DMU8 189 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 CT45A7P0DMV0 189 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 FABP4P15090 132 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 COL8A2P25067 703 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 LGALS7P47929 136 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 PRRX1P54821 245 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00205P59089 165 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 BPIFB3P59826 476 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 LMO4P61968 165 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 SELENOTP62341 195 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTL10Q5JWF8 245 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC01551Q86U37 167 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 Q8N7P7 452 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 NECAP1Q8NC96 275 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5T1Q8NG75 326 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5R1Q8NH85 324 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 SSMEM1Q8WWF3 244 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFRSF14Q92956 283 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 NABP2Q9BQ15 211 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 KAAG1Q9UBP8 84 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PRE2 83 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 M0QZ24 198 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 FSHBP01225 129 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-7P01780 117 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 C8orf88P0DMB2 117 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 SELLP14151 372 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP5G3P48201 142 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 PKIAP61925 76 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 CCL8P80075 99 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF90Q03938 601 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 CD69Q07108 199 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 RPEL1Q2QD12 228 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 HLA-DRB5Q30154 266 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 TIGITQ495A1 244 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM201AQ5SY85 155 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM78BQ5VT40 261 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR73Q6P4I2 378 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX29Q8N6K0 151 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 STXBP6Q8NFX7 210 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 OR9G1Q8NH87 305 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF596Q8TC21 504 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 LEAP2Q969E1 77 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR61Q9BZJ8 451 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM106BQ9NUM4 274 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 HELTA6NFD8 242 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 G3V4G9 280 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 H0YJW9 148 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 CORTO00230 105 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 COX7A2P2O60397 106 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 OR7C2O60412 319 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTL6BO94805 426 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 MT-ND6P03923 174 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5G3P0C626 314 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10J1P30954 320 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 GNG4P50150 75 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF137PP52743 207 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R60P59551 318 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP10-3P60369 221 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 PSG5Q15238 335 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF124Q15973 351 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 SPRNQ5BIV9 151 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 PYY3Q5JQD4 70 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 GCSAMLQ5JQS6 135 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 TCF23Q7RTU1 214 aa5.62□□□□□ -1.51
SMARCE1-201ENST00000264640 S100A7AQ86SG5 101 aa5.62□□□□□ -1.51
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