RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260356.5

THBS1-201, Transcript of thrombospondin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS1, Length 7,775 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1-201ENST00000260356 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 GNG5P63218 68 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 RHOGP84095 191 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 MORN2Q502X0 79 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 RAMP3O60896 148 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 FAM27E3Q08E93 113 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 EFNB3Q15768 340 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 RASL11AQ6T310 242 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.54□□□□□ -0.88
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THBS1-201ENST00000260356 CD55P08174 381 aa9.53□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 PTPN13Q12923 2485 aa9.53□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.53□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 OVOL1O14753 267 aa9.53□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 LILRA1O75019 489 aa9.53□□□□□ -0.88
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THBS1-201ENST00000260356 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa9.53□□□□□ -0.88
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THBS1-201ENST00000260356 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.53□□□□□ -0.88
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THBS1-201ENST00000260356 NR2C2APQ86WQ0 139 aa9.53□□□□□ -0.88
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THBS1-201ENST00000260356 TMEM133Q9H2Q1 129 aa9.53□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.53□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa9.53□□□□□ -0.88
THBS1-201ENST00000260356 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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THBS1-201ENST00000260356 A0A0U1RRA0 63 aa9.53□□□□□ -0.88
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THBS1-201ENST00000260356 CCL1P22362 96 aa9.52□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 OCC1Q8TAD7 63 aa9.52□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.52□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.52□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 LINC00271P0C7V0 271 aa9.52□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 MGAMO43451 1857 aa9.52□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 TMEM131Q92545 1883 aa9.52□□□□□ -0.89
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THBS1-201ENST00000260356 ZNF415Q09FC8 603 aa9.52□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa9.52□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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THBS1-201ENST00000260356 TNFSF13O75888 250 aa9.51□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 IGHV1-2P23083 117 aa9.51□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 C2orf82Q6UX34 121 aa9.51□□□□□ -0.89
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THBS1-201ENST00000260356 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.51□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.51□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 VWC2LB2RUY7 222 aa9.51□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 ZNF124Q15973 351 aa9.51□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.51□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 F8WEM9 126 aa9.51□□□□□ -0.89
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THBS1-201ENST00000260356 OBSL1O75147 1896 aa9.51□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 SP9P0CG40 484 aa9.5□□□□□ -0.89
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THBS1-201ENST00000260356 TIAF1O95411 115 aa9.5□□□□□ -0.89
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THBS1-201ENST00000260356 PRCDQ00LT1 54 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 TNFRSF14Q92956 283 aa9.5□□□□□ -0.89
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THBS1-201ENST00000260356 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.5□□□□□ -0.89
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THBS1-201ENST00000260356 TEX38Q6PEX7 206 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 COX11Q9Y6N1 276 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 C4orf51C9J302 202 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 FAM166AQ6J272 317 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 MESP2Q0VG99 397 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 INSP01308 110 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS1-201ENST00000260356 PYYP10082 97 aa9.49□□□□□ -0.89
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