RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 PAX1P15863 534 aa13.28□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 RNF125Q96EQ8 232 aa13.28□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa13.27□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 COX6A1P12074 109 aa13.27□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 RAX2Q96IS3 184 aa13.27□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 TMEM8BA6NDV4 472 aa13.27□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 CDCP2Q5VXM1 449 aa13.27□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 IGLC7A0M8Q6 106 aa13.27□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 TOMM7Q9P0U1 55 aa13.27□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 RNF115Q9Y4L5 304 aa13.27□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 PPP1R27Q86WC6 154 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A1Q86YD7 464 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 KIF26BQ2KJY2 2108 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 LCNL1Q6ZST4 164 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZVH6 145 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 SS18L2Q9UHA2 77 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 ASXL3Q9C0F0 2248 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 E9PQ18 207 aa13.26□□□□□ -0.29
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CTIF-201ENST00000256413 A0A0G2JRQ6 117 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 IGKV3-20P01619 116 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 PSG7Q13046 419 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 RNF144BQ7Z419 303 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 TMEM158Q8WZ71 300 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 SLC50A1Q9BRV3 221 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa13.25□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 GAGE12JA6NER3 117 aa13.25□□□□□ -0.29
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CTIF-201ENST00000256413 NPIPB5A8MRT5 1133 aa13.25□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 GAGE5Q13069 117 aa13.25□□□□□ -0.29
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CTIF-201ENST00000256413 IQCF6A8MYZ5 107 aa13.25□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 PLEKHB2Q96CS7 222 aa13.25□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 FAM186AA6NE01 2351 aa13.25□□□□□ -0.29
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CTIF-201ENST00000256413 FAM216BQ8N7L0 139 aa13.24□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 LIME1Q9H400 295 aa13.24□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa13.24□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 NKX2-8O15522 239 aa13.24□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa13.24□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 CRYGSP22914 178 aa13.24□□□□□ -0.29
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CTIF-201ENST00000256413 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
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CTIF-201ENST00000256413 H3BMM0 161 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 FAM201AQ5SY85 155 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZRM9 215 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 UBE2WQ96B02 151 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 CD28P10747 220 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 ABHD17AQ96GS6 310 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 KLHDC3Q9BQ90 382 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 MPDZO75970 2070 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 FOXF2Q12947 444 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 ZNF726P1Q15940 193 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 LINC00312Q9Y6C7 94 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 RFPL3SP0C7P2 107 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 CCL19Q99731 98 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 PSME4Q14997 1843 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 S100A7L2Q5SY68 101 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZT83 130 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 AMN1Q8IY45 258 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 SPANXDQ9BXN6 97 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 GHRHP01286 108 aa13.22□□□□□ -0.29
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CTIF-201ENST00000256413 TRAV40A0A0B4J280 105 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 TOMM40O96008 361 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 DEFB125Q8N687 156 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 UNC13CQ8NB66 2214 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 PRSS57Q6UWY2 283 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-201ENST00000256413 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.21□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 GLRXP35754 106 aa13.21□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa13.21□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZS49 121 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 A0A0U1RRA0 63 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 H3BMG7 143 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 ZNF688P0C7X2 276 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 NPC2P61916 151 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 C5orf24Q7Z6I8 188 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-201ENST00000256413 ZNF329Q86UD4 541 aa13.2□□□□□ -0.3
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