RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249700.8

TMOD2-201, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD2, Length 9,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-201ENST00000249700 TLN2Q9Y4G6 2542 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 TMEM219Q86XT9 240 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 GAFA1Q96PS6 74 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 RAB29O14966 203 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 IGLV2-14P01704 120 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 PSG5Q15238 335 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 LYPD2Q6UXB3 125 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 Q8NA96 180 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 CD5P06127 495 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF383Q8NA42 475 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 PROP1O75360 226 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 CA2P00918 260 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 FXYD3Q14802 87 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 ATP6V1FQ16864 119 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 NPPCP23582 126 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 B4DSR2 109 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 MFAP4P55083 255 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 AGMATQ9BSE5 352 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 IL19Q9UHD0 177 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 C15orf65H3BRN8 121 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 NDUFS8O00217 210 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 OR51G1Q8NGK1 321 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 IGFBPL1Q8WX77 278 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 IFT22Q9H7X7 185 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 WFDC12Q8WWY7 111 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 HIST1H2BAQ96A08 127 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 NPCDR1Q9BY65 106 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 IGKV1-16P04430 117 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 SPCS3P61009 180 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 CLEC19AQ6UXS0 136 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 BRD3OSQ6XYD6 125 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF600Q6ZNG1 722 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 C10orf126Q8N4M7 172 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 PRELID3AQ96N28 172 aa4.97□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa4.96□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.96□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 J3QR06 171 aa4.96□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 DMRTA1Q5VZB9 504 aa4.96□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa4.96□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 GLMPQ8WWB7 406 aa4.96□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.96□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 MGST2Q99735 147 aa4.96□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.96□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.96□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa4.96□□□□□ -1.61
TMOD2-201ENST00000249700 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 FAM169BQ8N8A8 192 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 KBTBD11O94819 623 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 OR10J1P30954 320 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 VENTXO95231 258 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 DLX6P56179 175 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 C22orf46C9J442 243 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 K7ENP7 123 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 ICAM4Q14773 271 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 EML6Q6ZMW3 1958 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 CEP192Q8TEP8 1941 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF506Q5JVG8 444 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 OR1L8Q8NGR8 309 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 RPL29P47914 159 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.95□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 C11orf94C9JXX5 98 aa4.95□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.95□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 H3BTX0 84 aa4.95□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 WNT2P09544 360 aa4.95□□□□□ -1.62
TMOD2-201ENST00000249700 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.9 ms