RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf170	A2RU37	121 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00862	A6NCI5	91 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5H14	A6NHG9	310 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	MFNG	O00587	321 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ARPC5	O15511	151 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CA11	O75493	328 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXH1	O75593	365 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFSF13	O75888	250 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	MPC2	O95563	127 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CGA	P01215	116 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	AKR1C4	P17516	323 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CXCL2	P19875	107 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	S100A11	P31949	105 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TAS2R46	P59540	309 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM3A	P98173	230 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R1A	Q13522	171 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	GUCA2B	Q16661	112 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CLLU1	Q5K131	121 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	LGI3	Q8N145	548 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	GATD1	Q8NB37	220 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	BORCS8	Q96FH0	119 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PECR	Q9BY49	303 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A22	Q9H936	323 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		3.65	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	LEUTX	A8MZ59	168 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CD79A	P11912	226 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	GABRR1	P24046	479 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TAF9	Q16594	264 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM42	Q69YG0	159 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PXT1	Q8NFP0	134 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4S2	Q8NH73	311 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	STARD4	Q96DR4	205 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	METTL26	Q96S19	204 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GXF2	115 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	C5orf49	A4QMS7	147 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ANGPTL7	O43827	346 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-23	P01764	117 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A4	P12235	298 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TCL1A	P56279	114 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2F1	Q13607	317 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8B8	Q15620	311 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CASC10	Q5T4H9	136 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC51B	Q86UW2	128 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	OSR2	Q8N2R0	312 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	COQ8A	Q8NI60	647 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CENPE	Q02224	2701 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	LRBA	P50851	2863 aa		3.63	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms