RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 FAM209BQ5JX69 171 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 OR11H1Q8NG94 326 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 OR4X1Q8NH49 305 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 NPIPB3Q92617 1050 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 DUX3Q96PT4 197 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 TXN2Q99757 166 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 NEURL2Q9BR09 285 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 HSPB11Q9Y547 144 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ANK2Q01484 3957 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 BMPR1BO00238 502 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 TGOLN2O43493 480 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 SCGB2A1O75556 95 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 C1QBP02746 253 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 OR10J1P30954 320 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 RUNX1Q01196 453 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 CLINT1Q14677 625 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 DPF1Q92782 380 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 RAX2Q96IS3 184 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 AQP10Q96PS8 301 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ATP6V0BQ99437 205 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 GGACTQ9BVM4 153 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 COL6A5A8TX70 2615 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 RNF222A6NCQ9 220 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ZFP92A6NM28 416 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 HMSDA8MTL9 139 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 FNDC10F2Z333 226 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 LINC01619G3V211 115 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 CCL24O00175 119 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 CTSGP08311 255 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 SLURP1P55000 103 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF616Q08AN1 781 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ATP6V1FQ16864 119 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 RPEL1Q2QD12 228 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 TIGITQ495A1 244 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ZFP69Q49AA0 526 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 OR4F4Q96R69 305 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ATP5SQ99766 215 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 MFFQ9GZY8 342 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 FBXL17Q9UF56 701 aa6.55□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 STAB1Q9NY15 2570 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 M0QZ24 198 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 DFFBO76075 338 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 OR2C1O95371 312 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 PF4P02776 101 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 IGLC1P0CG04 106 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ZP3P21754 424 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ADMP35318 185 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 MYCNOSP40205 109 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 VWC2Q2TAL6 325 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 TEPPQ6URK8 271 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 THAP8Q8NA92 274 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 HYLS1Q96M11 299 aa6.54□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 YIF1AO95070 293 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 TSPAN15O95858 294 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 IFNA5P01569 189 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1-17P01599 117 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 CXCL2P19875 107 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 FGF7P21781 194 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 SYNJ2BPP57105 145 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF90Q03938 601 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 OR2F1Q13607 317 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 FHL3Q13643 280 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF345Q14585 488 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 BTNL8Q6UX41 500 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 TRGV9Q99603 122 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 MGST2Q99735 147 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 WFDC1Q9HC57 220 aa6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.53□□□□□ -1.36
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