RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 AKAP14Q86UN6 197 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 CCNKO75909 580 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 GP9P14770 177 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 CD69Q07108 199 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 MRAPQ8TCY5 172 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 H3BP45 60 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 LY86O95711 162 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 IFNA4P05014 189 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 C8orf88P0DMB2 117 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC25A4P12235 298 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 RND2P52198 227 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 FCN2Q15485 313 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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CCL3L3-201ENST00000612839 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 MLXQ9UH92 298 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 C5orf51A6NDU8 294 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM25EA8MYX2 175 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 PRSS46E5RG02 174 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 K7EMT4 169 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 SSSCA1O60232 199 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 YIF1AO95070 293 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 SCGB1D2O95969 90 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV1-17P01599 117 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLC1P0CG04 106 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 PAX9P55771 341 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB11AP62491 216 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 NPIPB3Q92617 1050 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 MARC2Q969Z3 335 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 MED28Q9H204 178 aa8.55□□□□□ -1.04
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CCL3L3-201ENST00000612839 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 GAMTQ14353 236 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 TIGITQ495A1 244 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 LCN12Q6JVE5 192 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 BTNL8Q6UX41 500 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 ACY3Q96HD9 319 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 SMIM8Q96KF7 97 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 C2orf50Q96LR7 162 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB40CQ96S21 281 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 PSENENQ9NZ42 101 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 SSNA1O43805 119 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 CXCL3P19876 107 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 OR10J1P30954 320 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 IL15RAQ13261 267 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF785A8K8V0 405 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 K7EPK0 472 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 SCGB2A1O75556 95 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 TAS2R30P59541 319 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 Q8N1Y9 231 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 SMPXQ9UHP9 88 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 GOSR2O14653 212 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL3L3-201ENST00000612839 TSC22D2O75157 780 aa8.51□□□□□ -1.05
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