RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IL36BQ9NZH7 164 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCA4P78363 2273 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FCN1O00602 326 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NBR2O15453 112 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MOSP00540 346 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATRXP46100 2492 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ORM2P19652 201 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERVFC1-1P60608 527 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CFHR4Q92496 578 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PYYP10082 97 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NPBQ8NG41 125 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HYPMO75409 117 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TAS2R60P59551 318 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KLRD1Q13241 179 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 XKRY2A2RUG3 117 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDKN1AP38936 164 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLP1P60201 277 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR10D4PQ8NGN7 298 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FXYD5Q96DB9 178 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1W2PPR1 153 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A6NNC1 897 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OOSP1A8MZH6 123 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NDUFA3O95167 84 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NBASA2RRP1 2371 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPEL1Q2QD12 228 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OSTCQ9NRP0 149 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 I3L2K1 104 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC17A3O00476 420 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GCGP01275 180 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FABP4P15090 132 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EFNA4P52798 201 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR5I1Q13606 314 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HES1Q14469 280 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF329Q86UD4 541 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPL19P84098 196 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 V9GYV3 84 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ISLRO14498 428 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FABP1P07148 127 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGLC1P0CG04 106 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDLIM4P50479 330 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LGALS4P56470 323 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FXYD3Q14802 87 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PEX7O00628 323 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PYY3Q5JQD4 70 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZZEF1O43149 2961 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1W2PRD5 423 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1W2PRF3 423 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1W2PRM7 423 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GNLYP22749 145 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NDUFS7O75251 213 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGLV2-8P01709 118 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UQCRFS1P47985 274 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLXNB1O43157 2135 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PSG1P11464 419 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYCNOSP40205 109 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RANP62826 216 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RELNP78509 3460 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CD24P25063 80 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LYZP61626 148 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms