RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 CHEK1O14757 476 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 IGKV1-17P01599 117 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 TCRBP04435 133 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 OR10J1P30954 320 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 NPIPB3Q92617 1050 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 RNF2Q99496 336 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 ZMAT4Q9H898 229 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 SRD5A3Q9H8P0 318 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 MPTX1A8MV57 137 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 WRBO00258 174 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 TSPAN4O14817 238 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 SYNGR2O43760 224 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 NPPCP23582 126 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 BMI1P35226 326 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 RAB11AP62491 216 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 ZNF846Q147U1 533 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 OR1S2Q8NGQ3 325 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 BATF3Q9NR55 127 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 NUDT15Q9NV35 164 aa10.28□□□□□ -0.76
CTIF-207ENST00000589585 APOHP02749 345 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 IGLC1P0CG04 106 aa10.27□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 TFPI2P48307 235 aa10.27□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 RPP30P78346 268 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 HAGHQ16775 308 aa10.27□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 MZT2BQ6NZ67 158 aa10.27□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 Q8WTZ3 238 aa10.27□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 ST8SIA2Q92186 375 aa10.27□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 RCHY1Q96PM5 261 aa10.27□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 METTL26Q96S19 204 aa10.27□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 UBQLN2Q9UHD9 624 aa10.27□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 OR4C46A6NHA9 309 aa10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 H2AFB2P0C5Z0 115 aa10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 RPL11P62913 178 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 SPANXN5Q5MJ07 72 aa10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 TCF24Q7RTU0 167 aa10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 GBGT1Q8N5D6 347 aa10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 MITD1Q8WV92 249 aa10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 SLC35E1Q96K37 410 aa10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 GSKIPQ9P0R6 139 aa10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 TBC1D24Q9ULP9 559 aa10.26□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 UPK1BO75841 260 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 SCGB1D2O95969 90 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 RD3LP0DJH9 198 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP10.25□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 ID3Q02535 119 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 ASAH1Q13510 395 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 GAMTQ14353 236 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 LILRB2Q8N423 598 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 SEC22CQ9BRL7 303 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 TM2D3Q9BRN9 247 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 TMEM231Q9H6L2 316 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 A0A1W2PS18 150 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 ZFP92A6NM28 416 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 H3BP45 60 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 SSSCA1O60232 199 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 DFFBO76075 338 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 CD5P06127 495 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 CRYBB3P26998 211 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 PAFAH1B2P68402 229 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 WFDC3Q8IUB2 231 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 OR4D5Q8NGN0 318 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 SPATA25Q9BR10 227 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 VSIRQ9H7M9 311 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 FAM25EA8MYX2 175 aa10.23□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 CCSO14618 274 aa10.23□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 TOMM40O96008 361 aa10.23□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 IL4P05112 153 aa10.23□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 FAM90A2PQ658T7 463 aa10.23□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 ENKURQ8TC29 256 aa10.23□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 GRAMD2BQ96HH9 432 aa10.23□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 PSENENQ9NZ42 101 aa10.23□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 C5orf51A6NDU8 294 aa10.22□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 PSG1P11464 419 aa10.22□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 P2RY1P47900 373 aa10.22□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 ZNF90Q03938 601 aa10.22□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 ODF3L2Q3SX64 289 aa10.22□□□□□ -0.77
CTIF-207ENST00000589585 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms