RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589104.5

KDM4B-208, Transcript of lysine demethylase 4B, human

TSL 2

Gene KDM4B, Length 3,470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		10.82	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	OR8B2	Q96RD0	313 aa		10.82	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		10.82	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104		A0A1W2PPV4	95 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	DPRX	A6NFQ7	191 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104		Q56UQ5	140 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	RFESD	Q8TAC1	157 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	TSKU	Q8WUA8	353 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	JKAMP	Q9P055	326 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	NCOR1	O75376	2440 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	CT83	Q5H943	113 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	MOB3B	Q86TA1	216 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	CORT	O00230	105 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	OR7C2	O60412	319 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	NUDT3	O95989	172 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	TRIB1	Q96RU8	372 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	HES3	Q5TGS1	186 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	FAM168A	Q92567	244 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	OR2V2	Q96R30	315 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	DLL1	O00548	723 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	IGHV1-46	P01743	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	SLA	Q13239	276 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	SNURFL	B1AK76	121 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF253	O75346	499 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	TOX4	O94842	621 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	HLA-DQA1	P01909	254 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	C3orf79	P0CE67	100 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	REG1B	P48304	166 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM186	Q96B77	213 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF492	Q9P255	531 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	HELT	A6NFD8	242 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	BORCS7	Q96B45	105 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	MT-CO2	P00403	227 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	IGLV2-11	P01706	119 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	LTA	P01374	205 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	C8orf88	P0DMB2	117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	CRYBB3	P26998	211 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	SELENOV	P59797	346 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	WT1-AS	Q06250	92 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	RAB9B	Q9NP90	201 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		10.77	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		10.77	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.77	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		10.77	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	GP9	P14770	177 aa		10.77	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	ERVK-16	P61578	105 aa		10.77	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	MUC21	Q5SSG8	566 aa		10.77	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		10.77	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		10.77	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		10.77	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		10.77	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
KDM4B-208	ENST00000589104	MFAP2	P55001	183 aa		10.77	□□□□□ -0.69
KDM4B-208	ENST00000589104	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		10.77	□□□□□ -0.69
KDM4B-208	ENST00000589104	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		10.77	□□□□□ -0.69
KDM4B-208	ENST00000589104	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		10.77	□□□□□ -0.69
KDM4B-208	ENST00000589104	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		10.77	□□□□□ -0.69
KDM4B-208	ENST00000589104	GNG4	P50150	75 aa		10.77	□□□□□ -0.69
KDM4B-208	ENST00000589104	PSG9	Q00887	426 aa		10.77	□□□□□ -0.69
KDM4B-208	ENST00000589104	PRR31	Q5SQ13	230 aa		10.77	□□□□□ -0.69
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF575	Q86XF7	245 aa		10.77	□□□□□ -0.69
KDM4B-208	ENST00000589104	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		10.77	□□□□□ -0.69
KDM4B-208	ENST00000589104	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		10.77	□□□□□ -0.69
KDM4B-208	ENST00000589104	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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