RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	CCNK	O75909	580 aa		18.97	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	AKR1C1	Q04828	323 aa		18.97	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	GAMT	Q14353	236 aa		18.97	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		18.97	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		18.97	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		18.97	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	18.97	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		18.97	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM213	A2RRL7	107 aa		18.96	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	ZFP92	A6NM28	416 aa		18.96	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	RLN2	P04090	185 aa		18.96	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	IGLC1	P0CG04	106 aa		18.96	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	FOLR2	P14207	255 aa		18.96	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	DEFA6	Q01524	100 aa		18.96	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	IL15RA	Q13261	267 aa		18.96	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		18.96	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP10-11	P60412	298 aa		18.95	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		18.95	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	PRSS46	E5RG02	174 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	WIPF1	O43516	503 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	CBLN1	P23435	193 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	FCN2	Q15485	313 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	GINS3	Q9BRX5	216 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	NOTCH1	P46531	2555 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	DEDD	O75618	318 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV1-17	P01599	117 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	CXCL3	P19876	107 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	IGLV1-51	P01701	117 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	PET100	P0DJ07	73 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	BTNL8	Q6UX41	500 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229		Q8WTZ3	238 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	FBN3	Q75N90	2809 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	CST7	O76096	145 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	STX12	Q86Y82	276 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	MARC2	Q969Z3	335 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	PRR25	Q96S07	402 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229		E5RGE8	158 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	FABP1	P07148	127 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	DLK1	P80370	383 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	LCN12	Q6JVE5	192 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	LILRB2	Q8N423	598 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	MLX	Q9UH92	298 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		18.89	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		18.89	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	IGSF23	A1L1A6	192 aa		18.89	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229		K7EMT4	169 aa		18.89	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	TOMM40	O96008	361 aa		18.89	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	IL4	P05112	153 aa		18.89	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	RD3L	P0DJH9	198 aa		18.89	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	MPC2	O95563	127 aa		18.88	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF90	Q03938	601 aa		18.88	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	ARL16	Q0P5N6	197 aa		18.88	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	OR2F1	Q13607	317 aa		18.88	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		18.88	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	METTL26	Q96S19	204 aa		18.88	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		18.87	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		18.87	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		18.87	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	PSG1	P11464	419 aa		18.87	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	SULT1A1	P50225	295 aa		18.87	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	GUCA2B	Q16661	112 aa		18.87	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		18.87	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	THAP8	Q8NA92	274 aa		18.87	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	SORL1	Q92673	2214 aa		18.87	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	TRGV9	Q99603	122 aa		18.87	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		18.87	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229		H0YIZ8	118 aa		18.86	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	GP9	P14770	177 aa		18.86	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	BMI1	P35226	326 aa		18.86	■□□□□ 0.61
GPS1-223	ENST00000584229	P2RY1	P47900	373 aa		18.86	■□□□□ 0.61

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