RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 SRPXP78539 464 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 TNFRSF9Q07011 255 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 SMCO1Q147U7 214 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 PRSS54Q6PEW0 395 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 TMED4Q7Z7H5 227 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 METTL26Q96S19 204 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 MS4A6AQ9H2W1 248 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 LYSTQ99698 3801 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 RND2P52198 227 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 RPL11P62913 178 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 CCDC190Q86UF4 302 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 HSPB7Q9UBY9 170 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 A0A1W2PS18 150 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 IGLC1P0CG04 106 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 OR1S2Q8NGQ3 325 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-206ENST00000571409 CRYBB3P26998 211 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 ETFRF1Q6IPR1 90 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 NOXA1Q86UR1 476 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 DTD1Q8TEA8 209 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 RBKSQ9H477 322 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 IFNA10P01566 189 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 OR10J1P30954 320 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 TMEM128Q5BJH2 165 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 RNF183Q96D59 192 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 RYR2Q92736 4967 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 OR1S1Q8NH92 325 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 DEDD2Q8WXF8 326 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 U3KQ87 197 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 TRAV2A0A0B4J234 112 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 A0A0J9YWU9 116 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 P2RY1P47900 373 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 Q8WTZ3 238 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 RABAC1Q9UI14 185 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 VAMP1P23763 118 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 SPANXN2Q5MJ10 180 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 LYG2Q86SG7 212 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 FAM24BQ8N5W8 94 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 NPIPB3Q92617 1050 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 ACY3Q96HD9 319 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 CSTL1Q9H114 145 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 DEFB131AP59861 70 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 STXBP6Q8NFX7 210 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 GRAMD2BQ96HH9 432 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDNEP1-206ENST00000571409 SACSQ9NZJ4 4579 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 LEMD1Q68G75 181 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 SRRQ9GZT4 340 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 MPTX1A8MV57 137 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 IFNA4P05014 189 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 LRTM2Q8N967 370 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 U3KQE9 123 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 K7EQG2 157 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 PITX3O75364 302 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 IL4P05112 153 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 PPP1R1AQ13522 171 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 CENPSQ8N2Z9 138 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 JTBO76095 146 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 SFT2D2O95562 160 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 TOMM40O96008 361 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 RD3LP0DJH9 198 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 PMS2P11Q13670 270 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 INPP1P49441 399 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 C16orf54Q6UWD8 224 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 DCANP1Q8TF63 244 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 GATAD1Q8WUU5 269 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 TMED3Q9Y3Q3 217 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDNEP1-206ENST00000571409 CXorf65A6NEN9 183 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 HELTA6NFD8 242 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 IAPPP10997 89 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 PSG1P11464 419 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC25A6P12236 298 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 BAK1Q16611 211 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 GLMPQ8WWB7 406 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 CA1P00915 261 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF688P0C7X2 276 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 TRIQKQ629K1 86 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 STHQ8IWL8 128 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC35E1Q96K37 410 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 FAM90A26D6RGX4 464 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 HOXB5P09067 269 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 GAMTQ14353 236 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 RARRES2Q99969 163 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZFP92A6NM28 416 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 RAB11AP62491 216 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 DHRS2Q13268 280 aa22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms