RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	SSSCA1	O60232	199 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	IFNA10	P01566	189 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	PET100	P0DJ07	73 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	MFAP2	P55001	183 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	H2BFS	P57053	126 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RAB11A	P62491	216 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	SMIM8	Q96KF7	97 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312		I3L2K1	104 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312		K7EIM0	57 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312		K7EPK0	472 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	TSC22D2	O75157	780 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	NDUFB8	O95169	186 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	SIX6	O95475	246 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	MT-CO2	P00403	227 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RLN2	P04090	185 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	IAPP	P10997	89 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	SLC25A4	P12235	298 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	MYCNOS	P40205	109 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	TXN2	Q99757	166 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	GNB4	Q9HAV0	340 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	C15orf62	A8K5M9	175 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312		L7N2F9	121 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	CCL24	O00175	119 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV3-11	P01762	117 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	IFNA4	P05014	189 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	OR8U8	P0C7N1	319 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	CXCL3	P19876	107 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	ZP3	P21754	424 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	OPRK1	P41145	380 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	NPBWR1	P48145	328 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	PAX9	P55771	341 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	S100A10	P60903	97 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	VAMP2	P63027	116 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	DEFA5	Q01523	94 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF616	Q08AN1	781 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	FHL3	Q13643	280 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	PMS2P11	Q13670	270 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	FCN2	Q15485	313 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	DNHD1	Q96M86	4753 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	VWF	P04275	2813 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312		E5RGE8	158 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	LINC01619	G3V211	115 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	SCGB2A1	O75556	95 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	DEDD	O75618	318 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM50A	O95807	157 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	MFAP4	P55083	255 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	FGL1	Q08830	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	OR11H1	Q8NG94	326 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	OR4X1	Q8NH49	305 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	DCUN1D4	Q92564	292 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	DPF1	Q92782	380 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	OR5B12	Q96R08	314 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49

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