RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559099.5

HMG20A-208, Transcript of high mobility group 20A, human

TSL 5

Gene HMG20A, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HMG20A-208	ENST00000559099	ETV6	P41212	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	TMEM56	Q96MV1	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	PAX4	O43316	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	CLN5	O75503	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	ALPL	P05186	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	ID1	P41134	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	CLDN12	P56749	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099		Q6ZS49	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099		A0A0D9SG52	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	ISLR	O14498	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	FKBP6	O75344	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	COMMD9	Q9P000	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	ETV1	P50549	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	ST3GAL4	Q11206	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	MLANA	Q16655	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099		A0A0B4J293	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099		C9JCJ5	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	PRAF2	O60831	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	IL4	P05112	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	GYPE	P15421	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	TNFSF8	P32971	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	CRYBA4	P53673	196 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	DHODH	Q02127	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	P2RY14	Q15391	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099		G3V2T6	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099		K7EQD1	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	SNAPC5	O75971	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	KRAS	P01116	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	GABRB1	P18505	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	G6PC	P35575	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	ERVK-16	P61578	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	INSL4	Q14641	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	MSMO1	Q15800	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099		H7BYZ3	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HMG20A-208	ENST00000559099	SRI	P30626	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms