RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 SRRQ9GZT4 340 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 ENY2Q9NPA8 101 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 MLXQ9UH92 298 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF580Q9UK33 172 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 PRNDQ9UKY0 176 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM213A2RRL7 107 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 C2orf70A6NJV1 201 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 K7EIM0 57 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TGOLN2O43493 480 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 GNG7O60262 68 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 ADAP1O75689 374 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 MT-CO2P00403 227 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 CSN3P07498 182 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 IL7P13232 177 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 FOLR2P14207 255 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TBPP20226 339 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 UCP1P25874 307 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 FAUP35544 74 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 RND3P61587 244 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 PRCDQ00LT1 54 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 PPP1R1AQ13522 171 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 MSMO1Q15800 293 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 POU2AF1Q16633 256 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 ANKRD55Q3KP44 614 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 GGNBP1Q5YKI7 109 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC190Q86UF4 302 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 SGPP2Q8IWX5 399 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 CENPSQ8N2Z9 138 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 GBGT1Q8N5D6 347 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 DEFB125Q8N687 156 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 UXS1Q8NBZ7 420 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 OR1S1Q8NH92 325 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF502Q8TBZ5 544 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 GPR146Q96CH1 333 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 ACY3Q96HD9 319 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 USMG5Q96IX5 58 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM56Q96MV1 263 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 RBKSQ9H477 322 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM14BQ9NUH8 114 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 FBXL17Q9UF56 701 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 A0A0B4J293 547 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SMCO3A2RU48 225 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 MPTX1A8MV57 137 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 FAM25EA8MYX2 175 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 CTDSPLO15194 276 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 CYB5BO43169 146 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SSSCA1O60232 199 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 IFNA10P01566 189 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 IGLV1-51P01701 117 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 APOHP02749 345 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 BTCP35070 178 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SNCAP37840 140 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 CAMPP49913 170 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 RND2P52198 227 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 MFAP4P55083 255 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM187Q14656 261 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 CNPY1Q3B7I2 92 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 TIGITQ495A1 244 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 ZFAND6Q6FIF0 208 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 LCN12Q6JVE5 192 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 IL34Q6ZMJ4 242 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 GTSCR1Q86UQ5 136 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms