RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 OR52B4Q8NGK2 314 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 GRAMD2BQ96HH9 432 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 METTL26Q96S19 204 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB40CQ96S21 281 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 TUBA4BQ9H853 241 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 MLXQ9UH92 298 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 OR4C46A6NHA9 309 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 TSPAN4O14817 238 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 IAPPP10997 89 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 NPPCP23582 126 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 S100A7P31151 101 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 TOMM20LQ6UXN7 152 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 OR4D5Q8NGN0 318 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 ACY3Q96HD9 319 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 NEURL2Q9BR09 285 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 SMPXQ9UHP9 88 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 IGLC1P0CG04 106 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 TAS2R30P59541 319 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 C5orf51A6NDU8 294 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 ZFP92A6NM28 416 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF785A8K8V0 405 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 SCGB1D2O95969 90 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 SPANXN5Q5MJ07 72 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 GSG1LQ6UXU4 331 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 Q8N1Y9 231 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 NPIPB3Q92617 1050 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 SMIM8Q96KF7 97 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 ZMAT4Q9H898 229 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 PSENENQ9NZ42 101 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM25EA8MYX2 175 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 L7N2F9 121 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 CHEK1O14757 476 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 SSSCA1O60232 199 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 TSC22D2O75157 780 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 TOMM40O96008 361 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 RD3LP0DJH9 198 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 VAMP2P63027 116 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 TIGITQ495A1 244 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 SEC22CQ9BRL7 303 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 IGKV1-17P01599 117 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 GAMTQ14353 236 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 MLANAQ16655 118 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 OR51G1Q8NGK1 321 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 C2orf50Q96LR7 162 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM110AQ9BQ89 295 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 VSIRQ9H7M9 311 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 HELTA6NFD8 242 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 MPTX1A8MV57 137 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 OR11H12B2RN74 326 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 FNDC10F2Z333 226 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 CRYBB3P26998 211 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 CYCSP99999 105 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 NRARPQ7Z6K4 114 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 S100A7AQ86SG5 101 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 TRGV9Q99603 122 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 MGAT4CQ9UBM8 478 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 RABAC1Q9UI14 185 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 IL4P05112 153 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 EDN2P20800 178 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 AKR1C1Q04828 323 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 OR8G2PQ6IF36 304 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 MARVELD1Q9BSK0 173 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 H3BP45 60 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 TCF24Q7RTU0 167 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 THAP8Q8NA92 274 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF125Q96EQ8 232 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF2Q99496 336 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 GGACTQ9BVM4 153 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF24Q9Y225 148 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 CCSO14618 274 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGGTA-205ENST00000558534 PTTG1O95997 202 aa11.84□□□□□ -0.51
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