RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF580	Q9UK33	172 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A0B4J293	547 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1B0GW64	132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2T8	A6NH00	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	C15orf61	A6NNL5	157 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	YIF1A	O95070	293 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	CDS2	O95674	445 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	IFNA10	P01566	189 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	IGKV1-5	P01602	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	IL7	P13232	177 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	CTRB1	P17538	263 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR183	P32249	361 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	RUNX1	Q01196	453 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	WT1-AS	Q06250	92 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM187	Q14656	261 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	POU2AF1	Q16633	256 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	GUCA2B	Q16661	112 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	LGI3	Q8N145	548 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	CXorf58	Q96LI9	332 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	CACNG5	Q9UF02	275 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	AGRN	O00468	2067 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	NOTCH1	P46531	2555 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A0G2JRQ6	117 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	hDV102S1	A0JD36	115 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM25E	A8MYX2	175 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	LYRM1	O43325	122 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	GNG7	O60262	68 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	B3GALNT1	O75752	331 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	SFT2D2	O95562	160 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	IFNA21	P01568	189 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	CRYGC	P07315	174 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	SPN	P16150	400 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	UCP1	P25874	307 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	MFAP4	P55083	255 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	SPCS3	P61009	180 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	PRCD	Q00LT1	54 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP1R1A	Q13522	171 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF429	Q86V71	674 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	OR5B3	Q8NH48	314 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM230	Q96A57	120 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	RBKS	Q9H477	322 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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