RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	TMEM50A	O95807	157 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	IGHV3-48	P01763	117 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	CLEC3B	P05452	202 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	ZP3	P21754	424 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	PAX9	P55771	341 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	SMIM8	Q96KF7	97 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	RAB40C	Q96S21	281 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	PPP5D1	E7EU14	171 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222		K7EPK0	472 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	GPR183	P32249	361 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	OPRK1	P41145	380 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	MFAP4	P55083	255 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	TAS2R30	P59541	319 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	MLANA	Q16655	118 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	OR4C12	Q96R67	309 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	TXN2	Q99757	166 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	NMES1	Q9C002	83 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	TUBA4B	Q9H853	241 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-231	ENST00000552222	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222		H3BP45	60 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	IGLV1-51	P01701	117 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	IFNA4	P05014	189 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	ARL3	P36405	182 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	RAB11A	P62491	216 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	RAB32	Q13637	225 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	MED28	Q9H204	178 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	OR2T8	A6NH00	312 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	TGOLN2	O43493	480 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	TSC22D2	O75157	780 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	CCNK	O75909	580 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	CTSG	P08311	255 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	SLC25A4	P12235	298 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	CXCL3	P19876	107 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	FCN2	Q15485	313 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222		Q56UQ5	140 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	IL17D	Q8TAD2	202 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	PRSS46	E5RG02	174 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	OR2C1	O95371	312 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	ADM	P35318	185 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	NPBWR1	P48145	328 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	S100A10	P60903	97 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	CD300C	Q08708	224 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	RPEL1	Q2QD12	228 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	OR4X1	Q8NH49	305 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	CXorf65	A6NEN9	183 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222		L7N2F9	121 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	GNG7	O60262	68 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	CLN5	O75503	358 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	SYNJ2BP	P57105	145 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	VAMP2	P63027	116 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	GPHB5	Q86YW7	130 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		10.36	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222		H0YIZ8	118 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	RND2	P52198	227 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	PRR20E	P86478	221 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	PRR20C	P86479	221 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	PRR20D	P86480	221 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	PRR20B	P86481	221 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	PRR20A	P86496	221 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CS-231	ENST00000552222	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75

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