RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	CUL7	Q14999	1698 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	UPK2	O00526	184 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	IGHG1	P01857	330 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	REG3A	Q06141	175 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	PRNT	Q86SH4	94 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483		A6NIN4	97 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483		P0DMU3	169 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM231A	P0DMU4	169 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM231C	P0DMU5	169 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	SPRN	Q5BIV9	151 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483		Q6ZS92	163 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483		Q75L30	129 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	TEN1	Q86WV5	123 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	OR8B2	Q96RD0	313 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	PARP14	Q460N5	1801 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	TIMM17B	O60830	172 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	PCBD1	P61457	104 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	SS18	Q15532	418 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	MCEE	Q96PE7	176 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	RNF114	Q9Y508	228 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	CR2	P20023	1033 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	IGFBP7	Q16270	282 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	PCSK4	Q6UW60	755 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483		Q8N976	141 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	PRR32	B1ATL7	298 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM229A	H3BQW9	127 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483		H3BVH4	76 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	COX7A2L	O14548	114 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	ITSN1	Q15811	1721 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	C15orf62	A8K5M9	175 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF20	P17024	532 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	TWIST1	Q15672	202 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	PRSS33	Q8NF86	280 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	SBF1	O95248	1867 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483		A8MUN3	132 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	ATOX1	O00244	68 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	FOXS1	O43638	330 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	SYNJ2BP	P57105	145 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	C6orf99	Q4VX62	202 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	MKX	Q8IYA7	352 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	SOD1	P00441	154 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF56	Q15929	161 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	TSKU	Q8WUA8	353 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	EPOP	A6NHQ4	379 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	PTHLH	P12272	177 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	LINC01545	Q5VT33	79 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	OR2A5	Q96R48	311 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CNOT2-231	ENST00000551483	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		3.04	□□□□□ -1.92

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