RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547912.1

CS-210, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-210	ENST00000547912	YIF1A	O95070	293 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	SPN	P16150	400 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	CAV2	P51636	162 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	SLURP1	P55000	103 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	MFAP2	P55001	183 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	CD69	Q07108	199 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	RAB32	Q13637	225 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912		Q8WTZ3	238 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912		S4R3C0	116 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912		U3KQE9	123 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	ATR	Q13535	2644 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912		H3BP45	60 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	SAP30	O75446	220 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	DEDD	O75618	318 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	OR2C1	O95371	312 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	SIX6	O95475	246 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	TMEM50A	O95807	157 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	IGLL1	P15814	213 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	OR10J1	P30954	320 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	P2RY1	P47900	373 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	RND2	P52198	227 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	DLK1	P80370	383 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	RAB31	Q13636	194 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912		A0A1W2PS18	150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912		A8MWP6	167 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912		K7EMT4	169 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	CD5	P06127	495 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	CTSG	P08311	255 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	S100A11	P31949	105 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	SULT1A1	P50225	295 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	H2BFS	P57053	126 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	RAP2B	P61225	183 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	SELENOT	P62341	195 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	BAX	Q07812	192 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	METTL26	Q96S19	204 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	TRGV9	Q99603	122 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CS-210	ENST00000547912	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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