RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV1D-12P01611 117 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 TCL1AP56279 114 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 CD81P60033 236 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 INAFM1C9JVW0 142 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 M0R381 172 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 CGB7P0DN87 165 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 MPZP25189 248 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 MRAP2Q96G30 205 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 DEFB130BP0DP73 79 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 DEFB130AP0DP74 79 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 RUNX1Q01196 453 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 C2orf83Q53S99 150 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 OVOL3O00110 214 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 NDUFB8O95169 186 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 NUDT3O95989 172 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 COPS9Q8WXC6 57 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 PRR32B1ATL7 298 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 FGF16O43320 207 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 C7orf66A4D0T2 115 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 CXCL3P19876 107 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 CKS2P33552 79 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 M0R3E3 92 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 OR10C1Q96KK4 312 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 FOXC2Q99958 501 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 IGHV4-59P01825 116 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 CLLU1Q5K131 121 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 OR1P1Q8NH06 330 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 CCL24O00175 119 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 KIF26BQ2KJY2 2108 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 TDGF1P3P51864 188 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 DEFB131AP59861 70 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 SHISA9B4DS77 424 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 J3QRE1 110 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 CD5LO43866 347 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 VOPP1Q96AW1 172 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 RAB24Q969Q5 203 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 PLXNA2O75051 1894 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 RIPPLY3P57055 190 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 ELOBQ15370 118 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 FUT9Q9Y231 359 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 HELZP42694 1942 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 B4DEV8 164 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 BCL2P10415 239 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 GCGP01275 180 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 OR52E5Q8NH55 327 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 ASCL2Q99929 193 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1B-217ENST00000541869 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 Q6P435 159 aa8.4□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.4□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.4□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.4□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 IGFBP2P18065 325 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 PKIAP61925 76 aa8.39□□□□□ -1.07
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